卵巢是生成卵子并排卵、调节内分泌激素、平衡内分泌之器官，若是内分泌受到影响很容易导致卵巢出现问题，进而引起卵巢巧克力囊肿的发生。频繁的性生活。一些女性在房事上不加以节制，频繁的性生活或者频繁的更换性伴侣会加大性生活强度，长期如此也会引来一些疾病，比如卵巢巧克力囊肿，多发生于青春期少女或更年期妇女身上。
巧克力囊肿的早期症状是痛经，且呈进行性加重，有的也可没有症状，是由于不孕症，去医院检查时才发现的。巧克力囊肿的症状主要是月经量多、痛经、腹部包块，尤其是会出现性前时疼痛出血。
巧克力囊肿是会引起小腹疼痛的。巧克力囊肿在月经期的时候会出现下腹疼痛的，月经过后疼痛消失。并且如果是在非月经期，当囊肿发生了扭转或者是破裂，那么也会出现小腹疼痛的现象发生。巧克力囊肿的形成，主要是由于子宫内膜异位到卵巢处，并且由于里面的液体呈咖啡色的，所以又称为巧克力囊肿，这种囊肿一般是双侧的较多。
发生巧克力囊肿主要的病因是内分泌的因素，其次，分娩多次流产可引起输卵管堵塞，也是巧克力囊肿的病因之一，性生活过于频繁，也是导致巧克力囊肿的重要原因。也可能和压力过大等因素有关。
巧克力囊肿是由内分泌因素引起，这是常见的病因。卵巢虽小，却是产生卵子并排卵、内分泌激素、平衡内分泌的重要，囊肿多发生于内分泌旺盛的生育年龄，所以认为与内分泌失调有关。也可能因长期久坐造成，由于长期久坐或姿势不佳，月经前及月经期常有剧烈疼痛，导致经血逆流入输卵管、卵巢，引起下腹痛、腰痛，尤其有厉害的经痛，此即所谓巧克力囊肿。
月经不调：卵巢巧克力囊肿者通常会出现月经量过多的症状，这是相当常见的症状，又不少会出现经血较多且带劲的时间比较长的情况；痛经：痛经是巧克力囊肿的主要症状，一般是继发性的症状但会逐年加重，但是临床上也有少数并没有很明显的痛经症状。痛经多是从月经前就开始甚至是在周期的后半期就开始了，要持续一个月经期到月经后的数日才会结束消失，一般疼痛的部位会出现在下腹部位，或者是偏于一侧；性生活痛。
