完全性心内膜垫缺损进行手术治疗。如果患者出现肺动脉高压，肺循环阻力超过体循环阻力70%以上，可能要暂缓手术，或降低肺动脉压以后再进行手术治疗。其他患者一旦发现需早期进行手术治疗，手术包括关闭房室间隔缺损、修复瓣膜，减少瓣膜的反流。
先天性心脏病的类型和严重程度决定了其存活时间。有的对生命没有太大的影响，只能通过身体检查来检查，比如房间隔缺损、动脉导管未闭、主动脉狭窄、肺动脉瓣狭窄、三尖瓣下移畸形、主动脉窦动脉瘤等。如果是室间隔缺损、法洛四联症、艾森门格综合征等，都有室间隔缺损，如果房间间隔缺损太大，患者的预后就会变差，必须尽早手术，一旦错过了手术的机会，就很难存活到成人。
如果新生儿完全性心内膜缺损，属于先天性疾病。一般可通过手术治疗，但由于可以等他大一些再做治疗。平时一定要密切观察孩子情况。若有出现心跳急速或哭闹不停止，一定要带他到医院进行就诊。一定要通过母乳喂养，增强孩子的抵抗力。
完全性心内膜垫缺损是一种先天性疾病。应该及时到正规医院进行检查，在明确病因后再做下一步治疗的打算。完全性心内膜垫缺损可能会出现胸闷气短、呼吸困难等多种明显症状。也有可能是一种先天性的疾病，对于治疗首先可以考虑保守，主要是平时注意养护，避免疲劳的情况。平时多运动。在饮食习惯上要少吃油炸和辛辣的食物，也要注意少吃辛辣刺激性食物，太过油腻的食物，凉东西，应该清淡饮食。平时多喝水，不要喝浓茶。也要注意保暖，避免加重病情。
完全性心内膜垫缺损能治好，一般这种疾病都是先天性的，只要发现的早，治疗的快，是能治好的。建议行手术治疗，孩子出现心脏病，及早治疗也能恢复的好一些，随着孩子增大，心脏的负担加重，手术更难。手术后要注意休息，不要劳累，而且还需要定期复查。
通常来说，复杂先天性心脏病有左向右分流型先天性心脏病、右向左分流型先天性心脏病、无分流型先天性心脏病等。
通常来说，复杂先天性心脏病有左向右分流型先天性心脏病、右向左分流型先天性心脏病、无分流型先天性心脏病等。一种是左至右分流型，又称潜伏青紫色，是一种有血管导管没有闭合的畸形；二是右至左分支，亦称“青紫色”，其特征为主动脉全切及法莫四联症；三是不分流，又称无青紫色，以主动脉和肺动脉为主干和小血管为主。
