目前没有效的药物可以好的，盆腔子宫内膜异位症，导致的巧克力囊肿。部分活血化瘀，软坚散结的中药或中成药制剂，可能会延缓，巧克力囊肿的生长速度，促进陈旧性出血的吸收，但是疗效并不确切，效果也并不理想。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症中最常见的一类，巧克力囊肿随着病程的延长，囊肿内积血的不断增加，囊肿体积也随之增大。需进行手术治疗，术后出现卵巢早衰会引起潮热，失眠，脾气暴躁等不适症状。
巧克力囊肿一般的很少会导致不孕的，只要孕激素和卵巢的排卵功能正常就可以自然的怀孕的意见建议但是子宫内膜异位症容易对怀孕产生不好的影响，另外会导致痛经以及月经的量的异常。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种。只要子宫内膜出现在子宫腔以外其他的部位都可以称之为子宫内膜异位症。子宫内膜异位症的常见症状就是一个不孕的问题，子宫内膜异位症和不孕是一个非常对立的问题，就是说子宫内膜异位症很容易导致不孕。如果妊娠，本身对子宫内膜异位症又是一个非常好的治疗，它非常对立。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症异位的内膜长到了卵巢上，形成血性的、包裹性的液囊，也就是囊肿，所以称之为巧克力囊肿，由于自身有一些容易产生子宫内膜异位症的因素，即使是做完手术，很可能还会复发。
