牙齿矫正的过程中有各种副作用，对口腔卫生不好，牙齿上面粘的托槽周围容易引起牙菌斑滞留，时间久了容易引起牙龈炎。需要好好刷牙，控制牙菌斑。金属托槽也容易会导致口腔粘膜的创伤性溃疡，应该注意必要时使用正畸蜡保护。牙齿矫正的过程中，为了使牙齿移动，在牙齿上面施加外力，如果力量过大会引起牙根的内外吸收。
矫正牙齿治疗费用通常需要花费2万元到4万元左右，选择国产品牌的托槽需要2万元左右，而进口品牌的托槽需要4万元左右。如果正畸前需要通过拔牙减小牙量，则费用需多花费3千元到7千元左右。具体价格还要结合当地的消费水平。
矫正牙齿的时候，不单单是让牙齿变的整齐还可以使牙齿保洁、牙周健康、清除咬合创伤、解除咬合干扰、修复义齿做准备、改善颜面骨异常发育等改善口腔功能、消除影响咬合的不利因素、建立新的正常的咬合关系及神经肌肉状态。
在适宜的矫治力作用下，牙齿正畸是不会发生明显或难忍的疼痛。部分人在正畸的开始或加力后出现轻度的痛感或酸痛，但几天后即可缓解并适应。整个牙齿正畸的治疗疗程是8个月～2年半不等，因此不必担心牙齿矫正痛的问题。
牙齿矫正的坏处主要是有可能导致牙槽骨发生吸收，形成人为的牙周病，也可能会产正畸性牙龈炎或者是牙周炎，因为正畸需要移动牙齿及牙根，在移动过程中可能会使周围牙槽骨吸收。
