甲硝唑最常见就是对胃肠道的刺激比较大，会使婴儿肠道菌群失调，容易引起腹泻。如果必须要吃的话最好在48小时后在喂奶，这样对宝宝不会有影响。另外用药期间应戒酒，饮酒后可能出现腹痛，呕吐，头痛等症状，有肝脏疾病患者剂量应减少。甲硝唑是已经明确致畸的药物，不过现在已经升级b类型了。一般怀孕期间是禁止吃的，母乳期也要衡量病情利弊在医生了解病情下才能用。哺乳期要严格控制药品的摄入防止对胎儿发育造成不良影响，要加强适当的锻炼，保持良好的心态。
一般情况下，甲硝唑对胎儿有影响，孕妇禁用甲硝唑。
怀孕初期服用甲硝唑会引起胎儿的异常，特别是引起神经管异常。因此在怀孕期间，要注意避免服用甲硝唑，无论是外用或内服都要避免，以免对孩子造成不良的后果。如果真的要用药，可以在医生的建议下选用不会对孩子造成任何伤害的药物，不要自行决定用药，以免损伤胎儿的身体健康。
通常情况下，甲硝唑是不建议用于前列腺炎的，也叫灭滴灵。主要用于治疗滴虫性和厌氧菌，其中大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、变形杆菌是前列腺炎的主要病原体。最常见的抗生素是左氧氟沙星等喹诺酮类抗生素。
年龄在18岁以下的患者，由于害怕喹诺酮类药物对骨骼的生长有一定的影响，建议使用头孢类抗生素，但不建议使用甲硝唑。
一般情况下，如果是确定有滴虫感染的尿道炎可以甲硝唑进行治疗。具体分析如下：
甲硝唑是硝基咪唑类抗菌素，该抗菌素对滴虫、阿米巴原虫，以及梭形杆菌属、部分真杆菌、消化球菌和消化链球菌等厌氧菌有较好的抗菌作用。临床主要用于治疗和预防厌氧菌、滴虫所引起的感染。所以患有尿道炎的患者，化验尿道分泌物有滴虫，并确定有滴虫感染后，可以吃甲硝唑药物进行治疗。同时，建议患者日常多食新鲜蔬果，适度锻炼，早睡早起，保持良好作息。
哺乳期不能服用甲硝唑片。哺乳期是妇女的一个特别时期，由于需要哺乳，所以在这段时间里要注意用药。甲硝唑片能通过母乳进入宝宝的身体，引起宝宝的疼痛、过敏等。哺乳期得了滴虫性阴道炎或细菌性阴道病，可以用甲硝唑来治疗，但要避免口服。也可以用甲硝唑泡腾片来治疗，可以在阴道里放入甲硝唑泡腾片，必要时服用口服避孕药，在服药期间要停止哺乳。
通常女性妇科炎症吃甲硝唑的时间需要根据炎症的严重程度。一般而言，服用甲硝唑的时间为7-14天左右。
甲硝唑是一种比较常用的抗菌素，主要针对厌氧菌感染，而妇科炎症中通常是厌氧菌感染引起的，所以吃甲硝唑的治疗作用比较好。但是抗菌素不能吃太久，以免导致菌群失调，诱发真菌感染。吃甲硝唑可能会有恶心、呕吐等不适症状，所以建议饭后。
