做了药流有四十天了还在流血考虑有宫腔残留的可能性，有宫腔感染的可能性，有子宫复旧不良的可能性，有滋养细胞疾病的可能性，同时也不能排除可能是宫腔内合并宫外怀孕的可能性。首先需要做妇科彩超，观察一下子宫的大小，以及宫腔内有没有残留，同时也要观察宫腔之外，输卵管以及卵巢等其他部位有没有异常包块的存在。
药流两个月了还在流血，这是不正常的，要及时去医院做子宫B超检查，可以排除是否有流产不全的情况，因为在药物流产以后，如果有胚胎组织残存在子宫内无法排出体外，就可能会导致反复流血的情况出现。此外也要注意观察是否有阴道瘙痒、阴道异味等症状，因为在流产以后，如果出现了阴道或者子宫内的部分真菌感染性的疾病，也会导致反复不愈的流血。
一般来说，药物流产后一个月内仍有出血，大部分原因是因为不完整的流产导致的。服用完药后，如果怀孕物质没有完全排出，或有蜕膜残存，会造成一直出血的情况。无论是怀孕的原因，或者是脱膜层的残余，都会对子宫的缩小产生一定的作用。建议到医院进行B超检查，如果发现子宫中有残余的情况，则需要进行清宫。
此外，出血过多可能会导致生殖器炎症，建议患者在医生的指导下使用抗炎药物进行治疗。
药流后的出血一般在1～3周，总的表现是：出血一天比一天少；如果出血减少后又增多或一点都不减少或逐渐增多，都是不正常的。药流的副作用是流不干净。如果出血很大可以去医院B超检查。
药流后六天好出血正常的，女性在流产后阴道出血的时间不超过十天就可以，再就是需要注意在流产后早期的时间段积极的服用抗炎促进子宫恢复的药物，不要吃辛辣和寒凉的食物，再继续定期的复查B超看看较好的。
宫腔残留，如果孕囊排出之后，蜕膜不能完全排出在宫腔内堆积就容易出现阴道流血的情况，宫腔感染。宫腔感染引起阴道流血的同时，会伴有小腹疼痛、坠胀不适，甚至是发烧等，患者排出的血液会有腥臭味。滋养细胞疾病。滋养细胞疾病引起阴道流血，同时可能会出现肺部转移的情况。需要做肺部的胸片或者CT，同时需要做妇科彩超、血绒毛膜促性腺激素来明确诊断。子宫复旧不良。
