首先要治疗小儿的慢性肠炎，要根据孩子的肠道是否有不同的分类，如果是细菌性肠炎，可以口服一些抗生素，在医生的建议下使用。同时要及时的用药物来治疗儿童的慢性肠炎，如果病情稍微好一点的话，如果不及时停止用药，可能会导致病情加重。小儿慢性肠炎的患者可以及时前往正规医院，在医生指导下使用必要的药物进行治疗，改善腹泻、腹痛等情况。
如果慢性肠炎明确有细菌感染，可以使用抗菌药物，如头孢克肟、克拉霉素等。
如果慢性肠炎患者腹泻，可使用蒙脱石散止泻治疗。如果患者腹痛，可以使用山莨菪碱等解痉药物治疗。若患者出现慢性肠炎，应及时去医院就诊。药物需在医生的指导下使用。治疗期间患者要注意多休息，同时坚持清淡饮食，患者可以适当增加营养的摄入，有利于身体恢复。
通常来说，慢性肠炎治疗方法有很多，具体分析如下：
慢性肠炎主要是由细菌，梅毒，原虫等微生物感染引起，也可能是由于过敏变态反应等引起的，出现腹痛、腹泻、消化不良等症状，严重者还会出现粘液便或水样便。要多休息，多吃容易消化的食物，不要吃油腻、辛辣的食物，要注意腹部的保暖，还可以服用解痉剂和止泻剂，同时控制自己的情绪。
慢性结肠炎是指直肠结肠因各种致病原因导致肠道的炎性水肿，溃疡、出血病变，慢性结肠炎病多是身体虚弱、抵抗力差，胃肠道易并发感染。一般要长期调理，饮食上，生活中注意，可以服用抗生素进行治疗。
婴儿慢性肠炎是很难治好的。除了吃药以外，还要注意在饮食上多吃清淡有营养的食物，注意饮食卫生。饮食上应安排无渣、软食、易消化、营养价值高的食物为主，急性发作时需改为流质食物。要重视心理护理，长期腹泻会给孩子带来一定的精神压力，还会因此而引致失眠，所以要创造良好的小环境。
首先要看孩子的慢性肠炎是哪类型的，如是细菌性肠炎，这时是可用抗生素治疗的，具体用药可由医师指导服用，另外注意治疗儿童慢性肠炎要坚持用药治疗，否则在症状稍好点炎症没消退时停药是会引起复发的，所以一定要听从医嘱。
