治疗慢性附睾炎一般可以进行药物治疗、手术治疗。
1.药物治疗：慢性附睾炎主要是由于急性附睾炎没有完全根治，并且经常复发。慢性附睾炎的临床表现比较轻微，检查时会发现附睾部位有硬结，局部有压痛感，附睾不平滑，精索可能会变得更粗，此时可以口服敏感的抗生素，多喝一些水，这样可以有效的缓解病情。
2.手术治疗：但是，如果复发或者是抗感染的药物无效，可以选择手术摘除。
男性附睾炎不至于发展成为癌症，但是会引起前列腺、尿道等泌尿系统器官和精囊等生殖器官。还会引起继发性鞘膜积液等。可以应用敏感抗菌药物，局部给予热敷，理疗等、男性附睾炎会引起男性不育，可以到医院就诊，查明病因针对性治疗。
慢性附睾炎会影响生育，因为慢性附睾炎会直改变睾丸内的环境，降低精子的质量以及存活率，因此便可能出现输精管堵塞，性功能下降而引影响生育。因此当男性是睾丸炎后要及时治疗，同时做好护理，以避免病情加重。
慢性附睾炎有可能影响生育能力。这种疾病可能会影响精子的质量。如果精子质量差，将会影响未来的生育能力。现在建议进行阴囊彩色多普勒超声、降钙素原和CRP等检查。目的是观察疾病是否由细菌感染引起，并根据检查结果决定是否需要抗生素药物进行治疗。
对于男性来说，发生附睾炎是比较常见的现象，很多因素可导致炎症的发生，从而给男性健康带来很大的影响，而附睾炎可双侧发生，也有单侧发生的，当附睾发生炎症时，对生育是会造成一定的影响的，不过相对来说，一侧发生附睾炎比双侧影响要小。
