目前有效地治疗甲沟炎长肉芽的方法是把趾甲边缘切除一小条，然后把甲根生发层进行处理，使趾甲边缘不再有新的趾甲长出，以达到治疗嵌甲的目的。手术时间短、恢复时间短、创伤小、术后病人痛苦少、术后不影响清洁、不影响洗脚。注意饮食护理。
甲沟炎肉芽可以使用手术等方式治疗，具体分析如下：
甲沟炎通常是因为修甲时间太短，或是嵌甲入肉，导致局部发炎，局部发红，甚至化脓，通常都是要做手术的。局麻手术后，将甲的侧壁纵向切开，将刺入肉中的指甲剪掉，再将局部的脓汁及生长的肉芽切除。根据感染的程度，可以将一部分或所有的指甲切掉，避免甲沟中残留的甲片，否则会导致伤口很长一段时间都不能愈合。
不能，甲沟炎的肉芽要在甲沟炎完全愈合后，拔掉指甲或者是指（趾）甲的一部分切除后，才可以消除。
甲沟炎肉芽形成是因为甲沟炎的时间太长，导致甲沟软组织增生水肿，而细菌和毒素不清除，对软组织的刺激就会一直存在，导致肉芽无法清除。
甲沟炎拔甲时，需要对生长的肉芽进行搔抓，去除其中的腐朽物质，这样肉芽就会逐渐消失，手指（趾）甲的外观也会逐渐恢复。
甲沟炎化脓需要切排脓，用消毒碘伏或酒精擦干净，擦药膏用纱布包扎，你口服可以一些消炎药，左脚大拇指也不能浈水，避免浈水引起感染，这几天是不能吃辛辣食物，饮食清淡为主。
甲沟炎主要是鞋不合适长期挤压，摩擦引起的，由于长时间炎症刺激局部形成炎性增生的肉芽组织，已经手术过了，就应该没事了，如果看见有前兆，局部用碘伏消毒伤口，建议平时鞋穿的宽松点，透气点，尤其不能太瘦了。
