甲状腺囊肿治疗主要依据甲状腺囊肿的肿物多少、大小来决定。较小甲状腺囊肿无需治疗，较大甲状腺囊肿或者短期内迅速增大的甲状腺囊肿。由于甲状腺囊肿多数是良性，手术切除之后，一般无需再进行其它方面的治疗。但是如果甲状腺囊肿较多，甲状腺组织也进行了部分切除，可能造成一部分病人甲状腺功能减低，术后还需配合进行甲状腺激素的治疗。
甲状腺囊肿微创消融术效果一般较好。
甲状腺囊肿微创消融可避免传统的手术创伤，穿刺针局部高温具有坏死病灶凝固性、彻底清除病灶的效果。手术小时短，疗效显著。甲状腺囊肿微创消融术的主要局限性是甲状腺恶性肿瘤患者只能采用微创消融术切除肿瘤病灶，不能清洁周围淋巴结。但是可能会发生并发症，如喉管神经损伤等，手术治疗结束后，出现声音嘶哑、喉上神经损伤，喝水可能出现呛咳。
甲状腺囊肿微创手术可选择局麻或全麻。常规消毒术区，患者采取颈部后屈体位，标记胸骨上窝双侧指，选择颈前弧行切开，切开皮肤皮下组织，分离颈前肌群，切断颈前肌一部分，打开甲状腺包膜，仔细剥离囊肿，完全切除病变，避免损伤邻近神经或血管。
甲状腺囊肿微创手术为局部小切口手术，术后皮内缝合无需拆线。止血效果好，手术约需1~2小时，住院3天，术后5天可恢复正常。手术后，需服用抗炎药物以防止伤口感染。少吃辛辣刺激的食物，多吃新鲜水果和蔬菜。
一般来说，甲状腺囊肿能治好。
甲状腺囊肿是指在甲状腺中发现含有液体的囊状物。一般情况下，甲状腺囊肿属于良性病变，通常能治好。如果囊肿肿大不影响到颈部外观，或者压迫其他的器官和喉返神经，观察即可；如果特别大，影响美观，或造成身体不适，可以进行囊肿摘除术。
患者在日常生活中应当加强身体锻炼，注意保暖，饮食清淡，不吃刺激性食物多，吃富含钙质的食物，不要吃刺激和油腻的食物。
甲状腺囊肿的危害主要与囊肿的大小有关，小的囊肿并不会造成危害，但是囊肿比较大的时候可能会引起颈部不适，甚至压迫气管和食道，出现吞咽困难、呼吸困难等症状，所以甲状腺囊肿的主要危害在于压迫症状，同时也有可能继发感染破裂或癌变。所以甲状腺囊肿的危害比较大，小囊肿定期检查不会有太大的问题，如果囊肿比较大，可以做甲状腺手术、硬化或者射频消融等治疗。
甲状腺囊肿突然增大有可能是恶性病变，建议去内科做个甲状腺彩超排查肿块性质，甲状腺囊肿的危害是会引发急躁、胸闷、甲状腺肿大及眼球突出等症状，巨大疼痛的囊肿可造成吞咽、疼痛、呼吸困难等，还会出现颈淋巴结转移，引发痛苦不适感。尽快去就医，在医生指导下用药，多吃富含碘的食物，如海带，紫菜等。
