肠套叠的病因尚不明确，可能有以下几方面:
第一，饮食改变，出生后4-10个月会添加辅食，增加乳量，肠道疾病高发，婴儿肠道无法适应添加食物的刺激，肠道功能紊乱导致肠套叠。
第二，回盲部解剖因素，婴儿回盲部游离性大，回盲瓣肥厚，小肠系膜较长，婴儿回肠、盲肠直径较大，会有丰富的淋巴结组织，因炎症和食物刺激导致充血、水肿、肥厚，肠蠕动将回盲瓣向前推，牵拉肠管。
第三，感染病毒，肠道叠与肠道内腺病毒、轮状病毒可能有关。
第四，肠痉挛，自主神经失调，因食物、腹泻、炎症、细菌、寄生虫、毒素刺激肠道，肠蠕动功能节律紊乱，逆蠕动。
第五，遗传因素。
宝宝肠套叠后哭闹可能是腹部不适引起的。
肠套叠是儿童常见的一种肠道疾病，属于一种较为常见的肠道疾病，肠套叠是指一段肠管套入与其相连的肠腔内，并导致肠内容物通过障碍，绝大数肠套叠是近端肠管向远端肠管内套入。大部分是儿童，成人也会感染。孩子一旦得病，就会一直在哭泣。因此，在日常生活中要注意观察宝宝的反应，尽早发现并及时处理，避免耽误了病情，耽误了治疗。
4-10个月饮食在发生改变，这时正是添加辅食的时候，外来食物可能会引起小孩过敏或者引起肠道紊乱，病毒感染也会影响肠道紊乱，使肠道亢进，本身回盲部结构异常，其回盲部的比例比成年人大，如果回盲部结构异常容易引起肠套叠。
引起小儿肠套叠的原因很多，如病毒性疾病、轮状病毒腹泻、上呼吸道感染等。病理性的如小肠的梅克尔憩室、小肠息肉、小肠重复畸形等。病理性肠套叠的保守治疗效果欠佳，最终都需手术切除。
通常情况下，宝宝肠套叠灌肠后出现发热可能是变质食物刺激、炎症反应引起的。
肠套叠是指一段肠管套入与其相连的肠腔内。如果肠套叠导致肠道缺血、水肿，灌肠后可能导致炎症，所以发热可能是肠道炎症引起的。如果胃肠蠕动就快，容易被一些变质食物刺激导致蠕动速度紊乱，灌肠后容易导致发热。建议宝宝去医院做进一步检查，在医生的指导下进行治疗，同时注意给宝宝多喝水，及时补充水分。
通常情况下，宝宝肠套叠灌肠后出现发热可能是炎症反应引起的。
肠套叠是指一段肠管套入与其相连的肠腔内。如果肠套叠导致肠道缺血、水肿，灌肠后可能导致炎症，所以发热可能是肠道炎症引起的。若是发热持续不退、腹痛，建议宝宝去医院做进一步检查，在医生的指导下进行治疗，服用退烧药和进行物理降温即可。同时注意给宝宝多喝水，及时补充水分。
