乙脑灭活疫苗与减毒疫苗有很大的不同之处，就是因为乙脑灭活疫苗是由死病毒制作而成，副作用比较小，要经过多次的注射，才能在婴儿体内产生抗体。
反复的注射会使婴儿的疼痛和副作用的发生率提高。乙脑减毒疫苗是一种活疫苗，有一定的免疫排斥作用，副作用比较大，但是免疫效果好，接种次数少，对孩子的危害小，更容易为父母所接受。所以，乙脑减毒疫苗优于减毒疫苗。
乙脑（减毒）疫苗和乙脑疫苗的区别，疫苗是一种病毒，而乙脑疫苗中的细菌经过技术处理完全丧失活性，而乙脑减毒疫苗仍保留一定的毒力但不足以致病，但缺点是免疫缺陷的人接种可能会导致意外，所以理论上灭活疫苗安全性更高，减毒疫苗免疫效果更好。
白百破疫苗和乙脑减毒活疫苗是可以同时进行接种的。两种疫苗同时接种，一般不会增加疫苗接种后不良反应的发生几率。疫苗接种以后有可能在短时间内出现轻微的发热症状。应该间隔28天以上才接种。间隔开1个月接种，接种的时候注意多喂水，避免剧烈运动。注意接种百白破和乙脑减毒活疫苗时不要接种在同一条胳膊。
不会造成什么不良反应，也不需要再补打疫苗了。现在国家免疫规划疫苗是在8个月、和2周岁时接种乙脑减毒活疫苗。是免费接种的。而乙脑灭活疫苗是收费的二类疫苗，是家长自愿自费接种的疫苗。
麻风疫苗和乙脑疫苗可以一起打，但一般不提倡一起打。麻风疫苗主要是为了预防麻疹和风疹，乙脑疫苗主要是为了预防流行性乙型脑炎。不提倡一起打是因为患儿在接种疫苗后，有时会出现不良反应和过敏反应。临床常见的有接种部位局部红肿、硬结、发热、腹痛、食欲不振等。若患儿同时接种两种疫苗可能会加重不适症状。
需要注意在注射疫苗过程中，不要使消毒剂接触疫苗。疫苗复溶后有摇不散的块状物，复溶前疫苗变红，疫苗瓶有裂纹或瓶塞松动者，不能使用。疫苗复溶后立即使用完。本品为减毒活疫苗。
