指甲出现凹陷小坑通常是饮食不均衡和缺乏微量元素引起的。需要查一下微量元素和维生素d，注意有没有缺锌贫血和缺维生素。平时注意不要偏食，多吃蔬菜水果。多吃点新鲜的水果蔬菜，不能偏食。
手指甲上有小坑多考虑有真菌感染，继续发展下去，指甲会出现灰指甲等真菌性甲藓。可以外用药，有脚气的话，早点治疗脚气，避免用手指甲接触有脚气的脚。避免吃辛辣油腻刺激性食物，不要吃海鲜和牛羊肉。
双手指甲都有坚纹是家族遗传，有的人手指甲上有竖纹，是家族遗传所造成。如果人体出现了问题，有些会在指甲上表现出来，比如手指甲上有竖纹，出现现象就是因为在平时的饮食当中，所摄入的维生素比较少。
手指甲有针眼状小坑可能与缺乏维生素、甲癣等原因有关，建议对症治疗。具体分析如下：
1.缺乏维生素：如果手指甲缺乏维生素，甲床营养不良，可能会出现针眼状小坑，同时还可能伴有指甲变厚、甲床分离等情况。建议平时可以多吃鱼、虾、牛奶、胡萝卜等食物来改善症状。
2.甲癣：甲癣是皮肤癣菌侵犯甲板及甲下而引起的疾病，一般表现为甲增厚、甲质松碎、刺激性小坑等。建议患者可以通过激光治疗使用激光照射在局部，通常对病原菌有一定的抑制作用，能够改善症状。
手指甲和肉分离的话，一般考虑和真菌感染有很大的关系，形成了灰指甲可以采用局部应用抗真菌的药物来进行用药治疗，可以到医院皮肤科或外科就诊做一下身体检查，看具体情况如何，根据检查选择治疗，注意皮肤卫生，不要接触其他有害物质，注意饮食营养。观察有没有见红的现象，如果形成了甲沟炎的话，一般就会容易产生脓性分泌物增多，可以采用口服消炎的药物来进行用药治疗。
手指甲出现竖纹和凹陷，可能是由于营养不良原因导致的指甲变形，多半是缺铁、缺锌、缺钙的原因引起的，也是慢性疾病的表现，比如慢性肠胃炎。如无其他异常现象，可以针对微量元素检查，如果存在缺锌和缺钙症状的，可以通过补锌和补钙进行治疗，进指甲恢复正常光滑。