根据情况选择是否手术治疗。扁桃体肥大的病因有很多，需要对症治疗，一般是先进行药物保守治疗。若患儿两三个月药物治疗没有效果的，可考虑手术治疗。手术常用是低温等离子射频消融术。
一般情况下，小孩的扁桃体肥大可以进行手术治疗，但必须满足一定的手术指征，具体内容如下：
如果小孩的鼻咽部有 II级或 III级的肥大，会导致呼吸道变得更加狭窄，小孩还会有打鼾、长期张嘴呼吸等症状，会对小孩的睡眠产生一定的不良反应。另外，小孩出现扁桃体肥大，有反复的急性炎症感染等情况，需要进行手术治疗。如果小孩仅仅是扁桃体肿胀，并不会导致患者出现反复的炎症和感染，那么可以暂时随访。
咽部反复疼痛或反复发烧，如果一年四五次以上可以考虑行扁桃体切除术。这时要明确是不是扁桃体发炎引起的，有时咽痛不是扁桃体发炎所引起，而是其它的原因，切了扁桃体解决不了问题。还有些只是反复咳嗽的孩子多不是扁桃体引起的，不需要切除扁桃体。
出现扁桃体肥大一般多见于炎症等导致，可以到医院儿科就诊做一下血常规等检查，如果是细菌感染引起，可以使用消炎药治疗，平时注意多喝水，不要吃辛辣食物，避免着凉感冒。如果扁桃体肿大严重，影响了呼吸，可以考虑采取手术切除治疗，防止出现身体缺氧导致异常疾病发生。
通常情况下，如果是扁桃体和腺样体肥大已经影响到孩子的呼吸或听力，则需要做手术，但如果没有，则一般不需要手术。具体情况分析如下：
1、影响孩子睡眠时呼吸，比如打呼噜、张口呼吸等。2、肥大的腺样体会对咽鼓管咽口造成一定程度的压力，导致孩子的听力受到严重的损害。腺样体是从一开始就存在的，从6-7岁开始发育至最大，到10岁时开始出现。如果是腺样体肥大，通常会伴随着两侧的扁桃体的肥大，需要在手术中将两侧的肥大的扁桃体摘除，以促进其正常的生长。
可于扁桃体手术同时或单独切除增生的腺样体，手术方法有全麻和局麻，腺样体因反复炎症刺激而发生病理性增生肥大，并引起相应的症状者称为腺样体肥大，常见于儿童。
