主要筛查先天性甲状腺功能减低症，苯丙酮尿症，先天性肾上腺皮质增生症。也包括红细胞葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症的筛查。由于各地开展的检测项目逐渐增多，还可以自费进行近百种先天性代谢性疾病的筛查。
新生儿癫痫可以做发作间歇期的脑电图，发生癫痫的新生儿在不发作的时候，80%左右可以检查出癫痫波，从而可以做出明确的诊断。除了脑电图以外，由于癫痫的病因很多，所以还要做相应的检查。
大多数新生儿黄疸都不需要治疗，多喂糖水可使黄疸加快消退。症状严重者，可采用光照疗法。如果胆红素水平仍持续升高，需要换血疗法。也可以应用药物减少胆红素的产生，包括供应白蛋白，纠正代谢性酸中毒，肝酶诱导剂，静脉使用免疫球蛋白。
新生儿黄疸还需要分生理性黄疸和病理性黄疸，要看是生理性的还是病理性的，多晒太阳，晒太阳的主要原因就是阳光中有蓝光，可以退黄疸。很多妈妈因为室外下雨或者阴凉就不抱宝宝户外晒，其实是错误的，不管是下雨还是阴天，都可以在室外，不要一天到晚都在室内。
随着生理性体重下降，新生儿肿眼泡也会消失，大约在一周左右后会逐渐消退，胎儿生活在羊水里面，随着分娩出生以后，新生儿的眼泡看起来比较肿，这时可能身体的别的部位也会有一点肿。
新生儿睾丸积液是因先天性鞘状突没有闭合、损伤炎症等都可能是宝宝睾丸积液的原因，大部分可以在2岁以内自愈，如果孩子的积液比较严重，两岁后不能自愈，必要的时候是需要手术治疗的。
