经过及时治疗，病毒性脑炎通常不会有后遗症。
大部分的病毒性脑炎，如果能够及早发现，及早治疗，通常都能收到良好的疗效。此外，还需要及时的做腰椎穿刺，尤其是少量的脑积液，用有针对性的抗生素或抗病毒药物进行治疗，一般不会留下任何的后遗症。但如果治疗不及时，或采用了错误的治疗方法，则可能有后遗症，如失语、言语障碍、瘫痪、吞咽困难、癫痫等神经系统损害。
病毒性脑炎后遗症不能恢复，具体分析如下：
后遗症是指在发病1年后仍然存在一些症状和体征，没有特殊的治疗措施，需要进行功能训练，康复训练，对症治疗。癫痫发作是脑炎的主要并发症，也可能是一些精神症状，也可能是一侧肢体感觉障碍，运动功能不正常，严重的还会出现昏迷。癫痫发作时，若只发生一次，无需特别处理。如果有两次或更多的发作，则要常规使用抗癫痫药物。
一般情况下，婴儿病毒性脑炎是否有后遗症，需要根据婴儿的病毒性脑炎病情的轻重程度来判断。
如果婴儿是轻微的病毒性脑炎，及时给孩子进行抗病毒治疗，预防并发症的发生，多数情况下是能够痊愈的，一般情况下不会遗留后遗症。如果孩子病毒性脑炎的症状比较严重，伴有神经功能的损伤，可能会遗留肢体障碍、语言障碍或者是智力障碍等，需要尽早的给孩子进行康复性训练。
对于病毒性脑炎，经过正规治疗，大部分可以恢复的比较理想，如果会到后期出现后遗症，有可能会有运动落后病毒感染得到控制，但是对脑细胞造成一定损伤，造成一个大脑皮层的损伤的情况，也有可能会使智力出现相关的问题。不是脑炎的后遗症应该注意看是不是有抑郁的情况引起是应该用点调节神经的药物进行对症的治疗看。
病毒性脑炎主要病毒感染引起的病毒侵犯了脑部神经，只要接受正规合理的治疗，是不会留下什么后遗症的，如果病情比较重，就会有分泌抽搐的现象，就算经过正规的治疗也会有后遗症，就像说话不清楚，运动障碍，肢体瘫痪等。
应该可以，可用中药修复损伤脑细胞，特定药物含有丰富的神经营养因子、小分子多肽、多种氨基酸，这些有效成分可直接作用于脑细胞，具有促进蛋白质合成抗脑皮质缺氧、改善脑能量代谢、加速脑血液循环，促进大脑发育的功效病毒性脑炎复发死亡率不高。
