一般情况下，宝宝睡觉醒来咳一阵，可以通过药物治疗、日常护理等方法进行治疗。
1.宝宝睡觉醒来咳一阵，可以使用清热解毒的喷剂，如开喉剑喷雾，起到缓解咽部红肿的作用，如果是小儿扁桃体炎引起的，可以口服小儿咽扁颗粒对症治疗。
2.宝宝睡觉醒来咳一阵，可以在晨起的时候给孩子喝杯水，缓解气管干燥刺激的作用。若长期出现上述症状，建议到医院进行过敏源检测，如螨虫、灰尘、冷空气等，查明过敏源，尽量避开过敏物质，避免刺激性咳嗽。
百日咳大约在2个月可以痊愈。百日咳系百日咳杆菌所引起的急性呼吸道感染，属于传染病。在早期会表现为类似于急性上呼吸道感染的卡他症状，如发热、流涕、咽痛，随后进入咳嗽期，主要表现为阵发性咳嗽，咳嗽以夜间为主，无明显的肺部体征。
一般来说，宝宝睡觉醒来咳一阵可能是以下原因：
宝宝睡觉醒来咳一阵可能是有阵发性的咳嗽，主要是因为咽部的痰和炎症等原因引起的，家长可以遵医嘱给宝宝口服氨溴特罗口服液进行治疗，从而缓解身体不适。
家长应该让患儿注意休息，保持环境安静和室内空气新鲜，饮食宜清淡、易消化、富含营养，适当到户外活动，增加抗病能力。
是由暂时感冒引起的，应该首先注意孩子的保暖。饮用葱水或冰糖煮黑梨比较合适，能有效缓解感冒症状。必须注意多喝水，饮食应该多注意，不要吃味道太重的食物，并且要适当吃些药。
治疗百日咳大概要3千-5千元左右，治疗方式不同，医院级别不一样花费也有差别。各个医院收费标准都不一样，每个人的病情不同，患了百日咳，就应及时就诊，并积极进行抗感染处理，便能尽快缓解症状，缩短病程，最好的治疗方法就是用抗菌素治疗。而且在治疗期间，也要注意饮食调节，要保持每天的热量，维生素等营养的供给。特别是在发病期间，食物要软易消化。并少量多餐，随时补充。还要少吃冰冷，辛辣的食品。同时要让宝宝多喝水，保持营养均衡。
药物不对症引起的咳嗽加重，或者病情在好转引起的。中药常常是宣肺止咳，用了药肺气宣发以后，咳嗽会暂时的加重，但是随着咳嗽的加重以及痰液吐出，咳嗽过1-2天会明显得到改善。无需特殊处理，只需要继续用药就可以。
