先天性并指多指畸形的治疗方法有如下几种：
一、手术
如果患者无法站立或行走异常，则可以通过手术来进行治疗。
1、表皮：采用“Z”形的方法，将剩余的手指（趾）组织起来，用来覆盖分开的并指，当骨头并连的时候，将其连接起来，并连在一起，一边被肌腱下的皮的时候，再进行侧副韧带的修复。
2、平衡肌力：严重并指多指，由于有内部肌指头的异常，所以要进行肌腱止点再造。
3、调整骨力线：指骨力线不正常时应进行截骨，某些重度多指并指畸形中有三节拇、纵向括弧骨等结构，应进行截骨，以纠正力线。
二、其他治疗
手术后疤痕疙瘩应及早介入治疗，疤痕疙瘩是由于术后皮肤受损，导致的胶原蛋白过多而导致的一种真、原形态，呈现肿块状浸润，在医学上称为“良性真皮瘤”。
1、瘢痕注入：采用5-氟尿嘧啶及类固醇等在瘢痕部位进行局部注射。结，应用低浓度的甲基喋呤配合叶酸能明显地阻止疤痕组织的增殖，如果有明显的疤痕增殖迹象，应尽早进行治疗。
2、光电治疗：主要是激光和其它治疗方法，强脉冲激光和595nm脉冲色素激光具有吸收血红蛋能降低疤痕的供血和去红的效果，适合于肥胖的增生性疤痕或者疤痕疙瘩。
3、光纤治疗：将纤维引入疤痕的内侧，可通过光热法的直接效应，达到促进疤痕愈合的目的。
4、压力治疗：压力治疗应该在手术后尽早进行，给予手指上的压力可以减轻脚跟外侧旋转。
并指手术会存在一定的风险。并指操作有以下危险：
1、麻醉风险：有些病人的家人会担心麻醉会影响胎儿的智商，甚至危及胎儿的健康。由于麻醉医师使用药物的差异，需要与麻醉医师进行充分的交流。
2、手术本身的危险性：手指蹼部会再次发生融合，父母要注意孩子的病情，并与医生沟通。
3、有感染、开裂、植皮坏死的危险。
上述危险都可以通过父母和医生进行沟通。
小儿患有多指畸形要尽早到综合医院骨科、整形外科、专业的手术外科就诊。
让专科医师判断多指畸形类型和严重程度，确定治疗的最佳时机和手术方式。患儿多指畸形，手术时机一般在半岁后。小儿半岁前对麻醉的耐受能力较差，且手指过于纤细，神经血管肌腱解剖没有半岁后清晰。手术方式以切除为主，复杂的多指要采取两个手指合并的方式，恢复手指大小和功能。
并指需要治疗。
1、为了美观，有治疗的欲望，比如脚部并趾的病人，经常穿拖鞋出门。
2、并指对病人的手或足的功能造成影响，例如手指和食指并指，如果不加以治疗，会对病人的抓持能力造成一定的影响。
3、并指的两根手指长度不同，如果不能及时分离，会造成手或脚的畸形，比如指与指并指。
4、当足部的大脚趾与第二趾的结合形成时。
先天性并指多指畸形需要把手指分开，剩下的指骨就会被切掉。
这种疾病通常是由软组织连接而成，只在基部的基底，与其他关节相邻，而不是共同的。这样的话，切除起来就容易多了。有些手指多并指，是指骨有翘融合，这个是一种比较复杂的现象，通常可以将多余的指骨去掉，然后将另一根手指的指骨分开，这样会对正常的关节造成一定的损伤。
一般情况下，并指多指畸形不需要植皮，但如果是并指畸形，则需要进行植皮。
