如果新生儿黄疸，服用这种药物以后，有可能会出现拉肚子的情况，可以适当服用调整肠道菌群的药物。如果有新生儿黄疸，在服用药物退黄疸的同时，注意给孩子勤喂奶，多喝水，孩子勤解大便或小便，有利于排黄疸。
新生儿腹泻包括感染性腹泻，非感染性腹泻。由于引起腹泻的病因不同，病情表现和严重程度不轻型病例主要表现为一般消化道症状，每天腹泻数次至十余次，可伴有低热，吃奶差，精神稍萎靡，轻度腹胀，哭吵不安等。
新生儿拉肚子，多数是由于喂养不当或者宝宝消化不良引起可能性比较大。如果新生儿是母乳喂养，产妇在饮食上以易消化、流质、半流质、清淡饮食为主，避免服用辛辣刺激、油腻性的食物。
新生儿产生拉肚子的现象，主要是因为新生儿的消化功能还不成熟，所需要热量和营养物质比较多。一旦喂养或者护理不当就容易发生腹泻，父母要清楚造成宝宝腹泻的原因，尽量避免人为因素给宝宝造成的腹泻。合理喂养，加强护理，注意宝宝的精神状态、胃口、体重的变化，纠正不科学的喂养方法，若状况不能及时改善，应到医院接受治疗。
一般情况下，新生儿宝宝拉肚子可以通过以下方式进行治疗。母乳哺育的婴儿一天排泄7~12次，一般情况下会出现乳白色或稀水便。新生儿的日常排泄量是人工喂食5~10次。如果大便次数超出了平时的10-20次，大便的性质会发生变化，同时还会有水样便增多或者是绿色改变。新生儿腹泻可以通过补液和口服药物来进行，蒙脱石散是其暂停腹泻的首选。
母乳喂养的新生儿正常大便次数每天7-12次，颜色呈金黄色，偶有泡沫状便或稀水便。人工喂养的新生儿正常大便次数每天5-10次。超过正常大便次数，每天10-20次，大便性状改变，出现水样便增多、呈绿色改变，则考虑腹泻。可以使用抗生素治疗。