新生儿在出生后要打的是卡介苗和乙型肝炎，在生后三日就要进行皮下注射。
如有皮肤的病变、发烧等早产儿，可以暂时停止使用卡介苗，因为有可能存在先天免疫障碍的婴儿不能打卡介苗，以免引起身体的全面感染。在出生24小时以内注射乙型肝炎，第二、三次注射分别为1-6个月。如果母亲是乙肝病毒携带者，那么孩子出生后6个小时内要注射100个单位的高质量的乙肝免疫球蛋白，还要打乙肝疫苗。
卡介苗和乙肝疫苗可以一起打。
卡介苗是由减毒牛型结核杆菌悬浮液制成的活菌苗。卡介苗可与乙肝疫苗同时接种，不影响彼此效果，并能改善乙肝表面抗原阳性，但应分别向左，右两侧臂进行接种。接种24小时之内切忌沐浴，注意观察皮肤的表面状况及接种后的进食和排便情况、睡着了等，如果不舒服，要与接种机构取得联系，及时咨询医生。
乙肝疫苗注射的第一针是在小孩出生当天，即小孩分娩出来后的24小时内，越早注射越好，第二针在出生后的第二个月，然后第六个月注射第三针，这是正常注射乙肝疫苗的方法。另外现在为了减少母婴传播的概率，还要打乙肝高效价免疫球蛋白，共打两针，出生当天和出生后的第二个月各打一针。
宝宝要在出生24小时内立即注射乙肝疫苗，然后是一个月和出生半年时，一共三针。如果乙肝妈妈的孩子要在出生当天注射乙肝疫苗及乙肝免疫球蛋白，阻断乙肝感染，再一个月及六个月后注射乙肝疫苗。
乙肝疫苗和卡介苗能分开打，不在同一个胳膊。一定要分开手臂进行接种，通常是乙肝疫苗接种在右手，另一个接种左手，如果由于某些原因没能接种，乙肝疫苗接种在先，那就2周后再接种；如果后一个接种在先，那要1个月后再接种乙肝疫苗。
新生儿0.1.6个月全程接种，即在孩子刚出生时、1个月大、6个月大时分别接种乙肝疫苗，打满3针。由于乙肝病毒可经过胎盘或产道传播给婴儿，还可能通过哺乳、喂养等方式传播给婴儿，对于母亲乙肝表面抗原呈阳性的孩子，应在出生时即采用乙肝免疫球蛋白加乙肝疫苗联合免疫。
