梗阻性肥厚型心肌病主要是药物治疗。
梗阻性肥厚性心肌病是肥厚性心肌病类型之一，表现在静息下左心室流出道和主动脉峰值压力阶差超过或等于30毫米汞柱的梗阻性。目前对该病的病因及发病机制尚未完全清楚。它的治疗指南建议应用β受体阻滞剂以减少血流，减轻流出道梗阻的压力。在临床工作中，β受体阻滞药常被用于高血压和心力衰竭等疾病。如果对β受体阻滞剂不能耐受或存在禁忌症者，可考虑服用维拉帕米等钙离子拮抗剂来改善症状。对无明显心律紊乱者，可选用非选择性血管紧张素转换酶抑制剂如卡维地洛。但对压力阶差的严重增大，或伴重度心衰，窦缓者慎用维拉帕米，亦可考虑手术治疗。对心功能不全患者来说，需要同时应用其他抗心力衰竭药物才能有效地控制心脏功能。
需要注意的是，具体用药应在专业医师的指导下进行。
对于没有明显的临床表现，没有明显的临床表现是可以不必进行治疗的，这是由于病人的生命中没有明显的表现。若病人有临床表现，并有可能是因此病所致，可以服用美托洛尔，服用美托洛尔片；若病人的病情没有好转，可以转而使用维拉帕米。同时伴有心脏功能不全的病人也可以使用呋塞米片利尿；同时出现心律不齐的情况下，可以口服氨碘酮来提高心率。
一般情况下，非阻塞性肥胖型心肌病多是没有任何临床表现的，由于肥胖性心肌病是导致年轻人猝死的重要因素，所以要尽量做到劳逸结合，生活中要注意调节自己的心情，不要过于兴奋，如果病人有心悸、疲劳、心前区疼痛等情况，可以服用美托洛尔片、普萘洛尔片等，如果效果不好，可以服用维拉帕米片、地尔硫酸片，有较好的治疗效果，建议患者在医生的指导下使用药物进行治疗，以免对身体造成不良影响。
肥厚性心肌病需根据具体病症进行治疗。
肥厚型心肌病一时之梗阻性肥厚型心肌疾病，针对该病的治疗，可以选择药物保守治疗，常用的药物有纠正心衰的药物、逆转心室重构的药物，例如β受体阻滞剂等。梗阻型肥厚性心肌疾病比较危险。因为梗阻往往会出现低血压、恶性心律失常、心绞痛等症状。如果心排血量受阻，会导致机体供血不足，脑供血不足，冠状动脉供血不足，这是非常危险的。一般都会选择无水酒精消融，这样可以减轻梗阻，从根本上治疗。
一般情况下，隐性肥胖性心肌病，主要是由彩色超声、MRI等检测结果诊断为肥胖性心肌病，但一般不会出现明显的临床表现，这些患者一般不会出现明显的运动后胸闷、呼吸困难等表现。因为这些病人的平均寿命都很接近普通人，因此需要密切的关注，并经常进行心电图、心脏彩色超声、MRI等，并注意心室肌肥厚的改变，并注意是否出现了其他的临床表现。若没有明显的临床表现，应持续进行严密的随访；若病人有明显的工作呼吸障碍，可用倍他乐克等药物进行处理；若病人有心脏功能不全，应使用抗心衰的药物；若有心室颤动，应使用抗心衰药物，建议患者在医生的指导下使用药物进行治疗，以免对身体造成不良影响。