生理咖啡斑和病理咖啡斑的区别有病因不同、改善方案不同等。
1、病因不同：生理咖啡斑是一种遗传性皮肤病；病理咖啡斑多与系统疾病有关，如结节性硬化症、多发性黑子综合征、共济失调毛细血管扩张症、神经纤维瘤等。
2、改善方案不同：相较于生理咖啡斑，病理咖啡斑需要先进性原发疾病的治疗。而针对咖啡斑，患者可进行激光治疗，利用激光穿透皮肤，直接作用于皮肤内色素，使色素消散，从而达到去除咖啡斑的目的。
纤维瘤咖啡斑有明显的区别，纤维瘤叫做多发性神经纤维瘤，主要是指突起于皮肤的大块儿的肉留，而咖啡斑主要是伴发于多发性神经纤维瘤之后出现的一些褐色斑块儿，这种斑块不突起于皮肤的色素沉着，是一种伴发性疾病。纤维瘤的治疗主要还是选择手术切除，而咖啡斑的话可以选择激光祛斑，或者是选择使用一些外用的千百氢醌霜来进行漂白治疗。
口腔扁平苔癣是腔粘膜病，主要为口腔粘膜出现由白色丘疹组成的白色斑块和白色条纹等。局部病损处要去除刺激粘膜的残根残冠、调磨锐利边缘和陡峭的牙尖，拆除不良修复体等。
黏膜白斑和口腔扁平苔藓属于口腔上的病变。
黏膜白斑主要表现为：口腔粘膜上有一种不能被清除的白色损伤，不能用医学和病理检查来确诊，这是一种癌症或潜在的恶性肿瘤，不包括吸烟、局部摩擦等局部原因消除后会消失的单纯性过角化病。对粘膜白斑点的防治应遵循健康教育、排除局部刺激性因子、加强对肿瘤的监控与防治。口腔扁平苔癣是一种不具传染性的慢性炎性疾病。
药物治疗，口腔扁平苔藓是一种严重的粘膜病变，局部组织会出现疼痛症状，治疗扁平苔藓需要找到病因，药物诱导的扁平苔藓停止用药可以取得更好的效果，还可以给患者局部使用糖皮质激素治疗效果好。
如果有咖啡斑及白斑，通常是胎记、结节性硬化症、神经纤维瘤等因素所致，可以通过药物治疗、激光治疗、手术治疗等方式处理。
1.胎记：在发育过程中，色素细胞可能增生，形成咖啡斑、白斑等胎记。如果局部没有迅速扩大、瘙痒、疼痛等症状，一般无需治疗。若有美容需求，患者可以在正规医院进行激光治疗，使激光作用于胎记处，并破坏皮肤组织内的异常色素细胞，达到消除或淡化胎记的目的。
2.结节性硬化症：基因突变可能诱发结节性硬化症，使患者有长咖啡斑和白斑、智能减退、骨质硬化等症状。患者应尽快就医，遵医嘱使用西罗莫司胶囊、氨己烯酸口服溶液用散、托吡酯片等药物，以控制病情、缓解不适。
3.神经纤维瘤：如果患者存在基因缺陷的情况，可能导致神经嵴细胞发育异常，引起神经纤维瘤。此时，患者皮肤表面可能出现咖啡斑、白斑，还可能伴有脊柱侧突、血管增生等情况。患者应及时就诊，通过听神经瘤切除术、经颅视神经肿瘤切除术等术式来进行针对性治疗，以去除不同部位的病变组织。
