肛瘘最主要的治疗办法是进行手术，由于属于一种慢性感染性疾病，治疗周期比较长，很容易出现复发，通常是由于急性肛周脓肿，没有得到及时或者有效的治疗转变而来的，也有一些是患有肠道的慢性炎症性疾病，出现了肛周的反复的瘘口，手术以后，换药也非常关键，注意局部卫生，坚持坐浴。
肛瘘手术后彻底愈合需要一个月的时间，在手术后需要注意清洁以及感染的问题，手术后一个月内，要少吃或不吃辛辣刺激性食物。应当要尽量多休息，避免长时间的久坐，适当的可以进行一些体育锻炼，加速局部血液的循环，这对病症恢复也是极为有利的。
存在肛瘘这种疾病，尽快的早期手术。肛瘘可以大致分为两种，一种是低位的简单肛瘘，这种肛瘘可以通过手术直接把瘘道切开，然后处理内口，伤口愈合彻底，这种病就可以彻底的治疗好。
肛瘘的方法主要是以手术为主，肛瘘属于肛门局部肛管内感染，会有明确的瘘管以及内口和外口，长期反复发作会有外口不间断的有分泌物或者脓血流出，会刺激肛门局部皮肤，形成瘙痒或者刺痛。
肛瘘必须通过手术才能治疗。肛瘘有一个内口，一个外口，内外口之间还有一个瘘管。手术时要处理好内口，还需要完整地分离出内外口之间的瘘管，这样才能彻底治疗肛瘘。当然部分肛瘘的内口处于高位，或者瘘管比较复杂，且并未经常发作，不常出现炎症，因为做切除手术切除组织较多。
