首先要考虑是因为细菌感染因素的局部肿痛，建议先做检查明确诊断，确定为感染因素引起的需要积极抗炎治疗。囊肿、龟头炎等，一定要尽早到大型正规的男科医院检查和治疗，可服用消炎的药物，还可以采取物理治疗，针对局部生殖器的疙瘩，治疗效果非常显著。
阴茎疼痛多是由于炎症所引起的，还可能是由于海绵体损伤导致的。可以到专业的泌尿外科和男科检查尿常规和尿道的脱落细胞，以及海绵体血流多普勒检查，可以适当的服用一些消炎药帮助治疗。
需要注意急性尿路感染的可能，其病因主要是性生活感染、外生殖器卫生较差、包皮过长、性生活或手淫过频等情况，临床表现主要是排尿异常如尿急尿频尿痛、尿道分泌物、瘙痒、红肿等情况，停止性生活，注意外生殖器的卫生情况，及早到医院做尿液以及分泌物的检查，不要盲目的使用药物，以免掩盖病情等，是根据检查情况积极治疗。
大腿根部是坐骨神经走行的地方，腰椎间盘突出、梨状肌综合征等病人的坐骨神经受压迫时，会导致大腿根疼痛。大腿根部出现了疼痛症状，需要进行相关的检查。腰椎X线片、腰椎CT、腰椎的MRI等都是可以确诊的。也有可能是大腿根部的肿瘤，也有可能是其它的原因，可以根据X光照片和骨盆照片来判断。出现腰间盘突出的情况，可以躺在硬板床上，局部进行热敷，避免背、提、拿重物，避免腿部受到压迫。
痔疮是一种位于肛门部位的常见疾病，任何年龄都可发病，但随着年龄增长，发病率逐渐增高。痔疮的典型症状有间歇便后鲜血，嵌顿时疼痛。痔疮通常不会出现阴茎根部疼痛的情况。
