在临床上，引起性功能障碍的原因有：
第一点，就是生理上的问题，当人类变老时，性机能就会慢慢衰退。
第二，是心理上的原因，此外，也存在着一定的心理和心理问题，比如说患者在做爱的过程中会很紧张，也会因为之前的性爱失败而产生不正常的行为。还有一些性机能失调，这也许是因为宗教的文化观念造成的。
第三，也有可能是由于肥胖症引起的，患有糖尿病的患者，可能会引起性功能障碍。
一般情况下，男性功能障碍可能是泌尿系统疾病、龟头过度敏感、频繁发生性行为等原因引起的，具体内容如下：
1.泌尿系统疾病：如果男性患有泌尿系统疾病，在炎症刺激下，可能导致男性出现性功能障碍。
2.龟头过度敏感：如果男性龟头过度敏感，可能会容易在发生性行为时受到刺激，可能引起性功能障碍。
3.频繁发生性行为：如果男性频繁发生性行为，可能会对性功能造成一定的损伤，可能出现性功能障碍的情况。
当男性出现性功能障碍后，男性应及时就诊，通过生殖器彩超、阴茎传导测定等方式明确自身情况，再对症进行治疗。
造成性功能障碍的原因大致可以分成三类：生物因素、精神心理因素和文化因素。生物因素性功能障碍可能由遗传、健康状况、激素水平、年龄、疾病（包括慢性病、神经精神系统疾患、内分泌疾病、生殖器官病变）等多种原因所引起。药物、长期大量酗酒或吸毒者，也会出现性功能障碍。
性功能障碍是神经损伤、内分泌失调等原因引起的。
神经性勃起功能失调，这是因为主宰阴茎勃起的神经受损所引起的，我们把它叫做神经性勃起功能紊乱。比如前列腺癌，或者是直肠癌，做了手术，切除了前列腺，切除了直肠癌，控制阴茎勃起的神经，就在这两个器官的边缘，如果损伤了神经，就不能再勃起了。另外和还可能是男性的雄性荷尔蒙分泌不足，导致睾丸机能下降而导致的勃起功能紊乱。
性功能障碍的病因很多，有的患者受某种信仰观念的影响，会使患者对性生活产生反感，从而造成性功能障碍，还有的患者也会有器质性的疾病，例如糖尿病患者，睾丸发育不良等。
有些患者会有雄性激素和雄性激素的分泌不正常，从而引起性功能的紊乱。还有一部分患者由于精神上的问题，例如第一次发生性生活，精神上的紧张，没有足够的性经历，没有足够的性技能，会造成某些不正确的性欲，最终造成患者的性欲失调。对于这种情况，要想有效的解决，首先要解决的就是这些原因。
男性性功能障碍可能是海绵窦血管的功能受损、心理因素、早泄等原因导致的，具体分析如下：
男性性功能障碍的主要症状是阴茎勃起功能障碍和阳痿，海绵窦血管的功能损害是导致性功能障碍的原因之一，同时也要考虑到心理因素，PDE5抑制剂可以用于治疗。还有一种是早泄，这是由于阴茎头的敏感，或是由于射精的传入神经过于激动，所以可以外用局部麻醉药物，也可以口服5-羟色胺再摄取抑制剂达泊西汀。
