口腔扁平苔藓可以通过冷冻治疗。伴有不同程度粘膜红斑充血，发生于苔藓斑纹中间或周围，界限一般清晰，表明病情处于活动期。即病情活动期，粘膜轻度发红，界限清晰。可波及整个粘膜，而白色病损反而轻微，有时需仔细辨认才能分辨出，可发生于颊、唇部。
口腔扁平苔癣是腔粘膜病，主要为口腔粘膜出现由白色丘疹组成的白色斑块和白色条纹等。局部病损处要去除刺激粘膜的残根残冠、调磨锐利边缘和陡峭的牙尖，拆除不良修复体等。
口腔扁平苔癣的治疗方法，包括局部治疗、全身治疗。局部治疗是去除局部刺激因素，进行局部的封闭，对于比较轻的扁平苔癣有一定的效果。口腔扁平苔癣的治疗，并不能够明确的使口腔扁平苔癣完全恢复，都是一些对症性的治疗。
糜烂溃疡型病人应给予软食，忌辛辣刺激之物，如生葱、生蒜、海产品、牛羊肉等，忌烫食，应尽量较少对口腔粘膜的刺激，以有利于口腔扁平苔藓病人病情的迅速好转，加速愈合。有学者提出烟、酒、烫食、嗜酸辣、龋齿、牙齿不良修复体都可能是致病因素。口腔局部物理性损伤可能是口腔扁平苔藓的病因学因素，但不去除，对口腔扁平苔藓的治疗是不利的。宜多食新鲜蔬菜，水果。
目前尚没有特别有效的方法进行治疗。药物治疗一般以使用免疫抑制剂和糖皮质激素治疗为主，它是一种非感染性慢性炎症性疾病。典型皮损为紫红色多角形扁平丘疹，常有口腔粘膜损害。扁平苔藓是一种癌前病变，可能转化为癌。
口腔部位的扁平苔癣在2年时间，自愈是有的。但是这种自愈倾向，概率并不是特别的大。很多人在2年之内就算是消退了，很快也会再一次出现，主要是自身的扁平苔癣病因没有祛除，所以导致的这种情况。
