长期大面积使用，会因为吸收大量的红霉素进入血液，引起口服或注射制剂的不良反应，如恶心呕吐等消化道反应、肝功能损害、可逆性神经性耳聋等。由于抗菌药物的滥用，红霉素的耐药率特别高，长期使用会引起皮肤正常细菌耐药，导致医治失败。
通常情况下，红霉素软膏消除痘痘有效果，但具体效果因人而异。
皮肤油脂分泌过多、毛囊堵塞、痤疮丙酸杆菌繁殖等因素可能会导致患者出现痘痘，痘痘部位容易受到炎症刺激而发红。红霉素软膏是常用的抗生素类药膏，能够起到消炎、杀菌的作用，因此对痘痘也有一定的消除作用。如果患者的皮肤上存在痘痘，患者应该及时前往正规医院，遵医嘱使用红霉素软膏来治疗。
红霉素软膏通常用于体表感染，也可以用于龟头的外用。但是需要注意如果龟头炎症渗出液比较多，不要选择红霉素软膏以免影响分泌物排出，加重病情。渗出较多通常不用膏剂。此外，霉菌性包皮龟头炎亦不能使用红霉素软膏，以免加剧霉菌性包皮龟头炎症状，甚至引起病情的加重。
红霉素软膏和足光散是可以在一起使用的，足光散主要是具有杀虫止痒，敛汗，抑制霉菌生长的作用，红霉素软膏主要对一些细菌感染引起的一些皮肤病效果比较好一些，一起用也有更好的效果。
莫匹罗星软膏和红霉素软膏同样都是消炎、抗细菌感染的药膏，主要针对的皮疹是疖肿、丹毒、毛囊炎、痤疮、甲沟炎这类皮肤感染的疾病。莫匹罗星和红霉素软膏能够抑制感染部位细菌滋生，减少局部毛细血管周围炎症聚集等疗效。
通常情况下，婴儿能擦红霉素软膏。
红霉素软膏是局部用的抗生素，适用于疖肿、脓疱疹等皮肤细菌感染，婴儿能够很安全的使用红霉素软膏，因为红霉素软膏副作用很小，一般没有胃肠道反应、肝肾功能损害风险等，并且局部应用对皮肤细菌感染效果好，耐药性低，而且红霉素软膏不容易过敏，即便是对青霉素类、头孢类药物过敏的患儿，也可以很安全使用红霉素软膏。
