脊髓空洞症的治疗方法为手术治疗，这是因为目前没有确切的药物手段使脊髓空洞减小或消失，也难以使病者的症状得到持久和有效的控制，目前主流的手术治疗方法为脊髓空洞分流术和颅后窝减压术。一般对于有明确小脑扁桃体下疝和相应脊髓空洞表现的病者，都采取后颅窝减压术。
颈椎空洞症如果没有症状，一般无需治疗。
颈椎空洞症主要是因为先天性的或后天的疾病引起的。如果没有明显的临床表现，可以不做特别的处理。如果出现了严重的颈部异常，则要进行颈椎的矫形手术。如果有脊髓神经的压力引起的神经反应，应该尽快进行外科手术，以缓解神经受压力，促进神经功能的康复。术后还要配合口服甲钴胺注射液和鼠神经生长因子等营养神经的药物。
多数情况下，脊椎空洞症是无法彻底根治的，需要采取外科手段来减轻症状，减缓疾病发展，改善患者的生存品质。
脊髓空洞症是一种长期发展的病症，主要是由于多种因素导致的脊柱中心管膨胀，导致脊髓受损。如果是脊髓空洞症，有明显的神经损害迹象，说明脊柱的机能已经不能恢复，所以外科治疗只是减缓病情，减轻症状。患者也要保持良好的心态。
通常情况下，脊椎空洞症可以通过药物治疗、手术治疗等来治疗
1.药物治疗：脊椎空洞症，是累及脊髓的慢性进行性疾患，属先天性发育性脊髓异常，内有空洞形成。可以使用维生素B族、血管扩张剂、神经细胞代谢功能活化剂等，均可应用。
2.手术治疗：还可以通过手术来治疗，手术方法有后颅窝减压术、重建脑脊液流出通道等。
脊髓空洞症最好的疗法是手术，其原因是至今尚无精确的药物手段可以让脊髓空洞缩小或者消失，同时很难让病人的病症获得持久有效地控制，而现在主流的术式是脊髓空洞分流术、颅后窝减压术等。
通常对具有明确小脑扁桃体下疝及相应脊髓空洞（症）征象者均采用后颅窝减压术。如小脑扁桃体下疝等原因未明，或者虽有小脑扁桃体下疝存在而与其脊髓空洞轻重不符，则可考虑行脊髓空洞分流术；若为存在寰枕部前方畸形并形成受压时还可考虑前路减压术治疗。
