免疫系统疾病非常多。免疫系统具有免疫监视、防御、调控的作用，就可以出现免疫系统疾病，平时最常见的是过敏原因造成的免疫性损伤。产生抗体，发生免疫，而造成发病。也可能是自身免疫性疾病所以会出现自身免疫损伤破坏性疾病，可以出现结缔组织病，风湿关节炎，系统性红斑狼疮等，以及多发性硬化症，重症肌无力脱髓鞘病变，慢性甲状腺炎，溃疡性结肠炎、甲亢、甲减等。还有肺肾出血性综合征，自身免疫性的肾小球肾炎。
免疫系统脑炎患者吃清淡食物通常比较好。
免疫系统脑炎通常是指自身免疫性脑炎，这种疾病的患者的抵抗力通常会很差，平时要多吃一些新鲜的水果和蔬菜，例如香蕉、苹果等。另外，患者平时也要多吃些易消化的食品，如馒头、面条等，以免加重胃肠道负担，防止出现恶心、呕吐等症状。此外，患者要注意不要食用过多的油腻食物，同时可以多吃一些含有丰富蛋白质的肉类，例如鸡肉、牛肉、鱼肉等。
免疫系统的疾病有很多，比较常见的是系统性红斑狼疮，干燥综合征，类风湿关节炎，强直性脊柱炎等，这和平时的生活习惯有很大关系，日常生活中，我们要多食用一些高营养，高蛋白的食物来补充营养提高自身免疫力，尽量不要食用一些辛辣刺激的食物。
如果是感染性疾病，发热是机体的一种积极反应，通过发热，调动机体的免疫机制起到防御功能，而如果没有发热反应，说明机体的应答反应相对较弱，更容易掩盖病情。平常让宝宝加强营养，营养均衡，多吃钙铁锌丰富的食物，多晒晒太阳。只要照顾好宝宝，一般宝宝都不会发烧的。一旦宝宝出现发烧，那也多见的是病毒感染引起的，不要给宝宝乱吃抗生素，可以口服的清热解毒的药物消炎口服液和抗病毒之类的药物就可以的。
脑炎与自身的免疫系统相关，当病人自身免疫力较差时，会导致免疫缺陷性病变。
某些病菌，如细菌、病毒、霉菌等，很可能会通过人体的血液传播，进而影响到中枢神经，从而引发脑炎。也有可能是由于Hiv病毒引起的免疫系统的不足，从而引起了真菌感染，从而引起了细菌感染的脑炎，例如隐球菌感染会引起隐球菌性脑炎。这种情况下，要进行抗菌药物的治疗，并且会有一定的难度，病人的预后也会很差。
免疫系统出现紊乱，可以多喝酸奶，坚持均衡饮食。多喝开水，能使鼻腔和口腔内的黏膜保持湿润，感觉清新充满活力。经常喝茶，茶叶中含有茶氨酸等化学物质，能够调动人体的免疫细胞，抵御细菌、真菌和病毒的感染。