大多数是和遗传因素，药物，病毒感染以及母体有关，怀孕期间患有如贫血、糖尿病、严重营养障碍等慢性疾病都有可能会引起唇腭裂。也有可能与早期感冒，用药，病毒感染，叶酸缺乏等有关。
唇腭裂患者后代发生唇腭裂的机会是正常人的3-4倍，孕期接触不良环境也可引起唇腭裂，如孕早期接触放射线、服用感冒药等，由于患儿出生后即可表现出唇部或腭部裂隙、畸形，因此唇腭裂的诊断较为直观。若患儿仅腭部裂隙、畸形，患儿父母无法发现。但是患儿饮水或吸奶时，将发生倒流或呛咳，此时到专业医生处就诊，大多数可以发现。唇腭裂胎儿期，妊娠五个月后，即可诊断出。
各种药物的副作用是导致胎儿畸形的重要因素，已证实妊娠早期服用羊癫症药物，孕期大量服用维生素A，都可引起先天性唇腭裂。不良的嗜好，怀孕期间抽烟、饮酒或服用含酒精的饮品也有一定原因。
胎儿唇腭裂形成时期主要是怀孕头3个月，这段时间是非常重要的，如果孕妇缺少叶酸就会容易导致胎儿畸形，另外如果缺少维生素A和B可导致新生儿先天性唇裂、腭裂，这些都是需要特别关注的。
唇腭裂是口腔常见的先天畸形，发病率约为不高。在一个正常的胎儿中，在生命的第五个星期后，几个胚胎突起逐渐融合在一起形成面部，如未能正常发育便可发生畸形，其中包括唇裂。孕妇在怀孕期间应避免偏食，保证维生素B，C，D及钙，铁，磷的充分摄入，保持心境平和，避免精神紧张。
通常来说，乳果糖在早餐前吃效果更佳。
乳果糖在结肠中被消化道菌丛转化成低分子量有机酸，导致肠道内pH值下降，并通过保留水分，增加粪便体积，有助于刺激结肠蠕动，保持大便通畅，缓解便秘，同时恢复结肠的生理节律，一般不被肠道吸收，可以通过疏通肠道达到通便的作用，建议在早餐前服用，最好是一次服用，有助于缓解症状。
