潜伏期10-15天。大多数患者症状较轻或呈无症状的隐性感染，仅少数出现中枢神经系统症状，表现为高热、意识障碍、惊厥等。体温持续上升，可达40℃以上。初期症状逐渐加重，意识明显障碍，由嗜睡、昏睡直至昏迷。昏迷越深，持续时间越长，病情越严重。
孩子打完乙脑疫苗后发烧一般不会超过三天,乙脑疫苗作为外源性的致热源,可以引起机体发热,这种发热一般大部分孩子都是低热,很少有高热的,持续时间不超过三天,大部分孩子在一天左右。另外，乙脑疫苗接种后的不良反应还包括注射局部红肿、疼痛以及食欲不振、胃肠不适等消化道症状，一般持续3天左右就会自动消失。在生活当中也应当注意，不要过度的情绪激动，不要吃热性的食物，多吃蔬菜水果。
注射乙脑疫苗以后，在24小时之内，不能洗澡，保持局部皮肤干燥清洁，防止继发性感染。乙脑疫苗比较安全，仅有少数小儿会出现不良反应。注射乙脑疫苗后可出现发热，还可出现头痛、头晕、乏力、寒战等全身症状，也可出现腹痛、腹泻、呕吐等胃肠道症状。
乙脑可以治疗好，但是仍然有一定的死亡率，部分病例可能留有严重的后遗症。流行性乙型脑炎是由乙型脑炎病毒感染所引起的以脑实质炎症为主要病变的急性传染病。
儿童接种乙脑疫苗后，是比较容易发热的。疫苗属于人工自动免疫抑制剂，这对于宝宝来说，是一种外来物质，会激发宝宝的免疫系统而出现身体的发热。这种热不会超过38度，不会有明显的不适症状，短期以内就会消失，也可以采取物理降温的方式去控制体温。
