复杂性肛瘘在肛肠科中属于大手术，其手术难度常见原因如下，复杂性肛瘘内、外口较多，且不易找到，往往需借助影像学检查，如盆腔磁共振、腔内B超确定位置，肛门直肠位置狭小，手术器械操作困难，手术耗时长，为保护肛门直肠环境，手术往往需进行两个多小时。
肛瘘一般指瘘管分支数量多或外部开口复杂，在一个内部开口中有多个分支，甚至延伸到盆腔内形成复杂肛瘘的肛瘘。一旦发现，都需要尽快手术切除，因为随着时间的推移，它会导致越来越多的瘘管甚至严重的局部感染。
复杂性肛瘘不进行治疗肯定是不行的。首先是导致肛瘘的病因不明，其次是肛瘘情况复杂，找不到原发病灶而处理困难。手术有可能出现一次手术不能恢复现象，大多一次是能治好的，这就是手术的风险。
复杂性肛瘘的主要症状就是肛门会来回的流脓和流血，并且可能会出现疼痛的症状。肛瘘只能通过手术的方法进行治疗，手术之后还是要按时进行换药，注意保持创面的清洁，保持创面引流通畅。所以还是需要及早的通过手术的方法进行治疗。
复杂性肛瘘是指有两个以上瘘管，临床依据其有两个以上外口，或瘘管较长并弯曲的肛瘘。此病的治疗，一旦发现，还是需要进行手术治疗的。此病一般不会发展为癌症的，但是一旦出现还是会出现肛门流脓，疼痛，肛门周围瘙痒感，肛门处疤痕形成，影响排便等。应及时的进行手术治疗。
可以依据自己的身体情况适当做一些运动的，但是注意平时要清淡饮食，多吃蔬菜和水果，避免油腻辛辣刺激性食物，适当运动，戒除烟酒，也可以在医生的要求下，服用一些药物来调理。
