卵巢囊肿根据大小、位置、性质不同，治疗方法不同。一般以手术治疗为主，要看是否恶性，囊肿的部位，体积，大小和生长速度。如畸胎瘤，B超、平片检查可发现牙齿、骨头等特殊结构，肿瘤超过3-4cm需要进行手术处理。其它囊肿、肿瘤并无此典型表现。
卵巢囊肿一般为慢性附件炎的一种临床表现，根据囊肿的大小采取的治疗方式也不同，一般3厘米以下的囊肿通常考虑属于生理性的，一般是可以自行吸收的，通常是无需治疗的，否则大于3厘米以上的囊肿需要手术或者药物治疗的。如果囊肿大于5厘米以上需要手术治疗，一般进行积极治疗是可以治疗的。
卵巢囊肿的病因并不是很清楚，可能有多方面的原因，有的是先天性的，有的与内分泌有关系等。另外，对于卵巢囊肿的治疗，药物治疗是没有作用，除非是手术治疗，但大多数很小的囊肿不需要治疗。不知道病人的囊肿大小，若是囊肿小于5cm，定期复查就可以。
卵巢切除手术，这应该是可以治疗好的，手术是彻底治疗卵巢囊肿的方法，药物治疗一般只有控制才能彻底治疗。大多数人不会复发，当然也有少数人会复发，所以术后定期检查，注意休息，保持好心情。
囊肿病人必须要注意自己的饮食卫生，避免食用过于油腻的东西，因为脂肪的堆积影响伤口的愈合，减弱身体对细菌的抵抗力。可食用适量食用蔬菜水果，其中含有丰富的维生素和矿物质，能提高身体的抵抗力，帮助伤口的愈合，注意多喝水。避免高度紧张或过大的精神刺激，保持乐观的情绪和充足睡眠。
