自然流产第三天了腰疼可能是多种原因导致的，具体分析如下：
如果女性在自然流产后三天会感到腰痛，可能是由于受了某种寒气的刺激，也可能是由于没有休息好，也可能是由于工作过度导致的。在流产后要多休息，不要过度劳累，不要做太多的体力活，要让自己的情绪得到充分的释放。同时要注意保持外阴的卫生，经常更换卫生巾，在一个月之内不能同房。需要到医院做个全面的检查，确定是什么导致了自然流产，然后才能对症治疗。
可吃一些有营养的食物。当然可以用猪肉。如果包皮过长，必须进行包皮环切。否则，如果包皮过长，很容易藏污纳垢，影响性生活质量。包皮环切术后伤口护理非常重要。为了避免做太剧烈的运动，不要吃辛辣的食物来刺激感冒。性是被禁止的。
手术后宫腔内会残留有淤血或者少量的胚胎组织以及子宫蜕膜，在第三天的时候，由于子宫收缩，这些组织或者淤血就会排出来。这个时候的疼痛有可能是子宫收缩引起的疼痛，也有可能是流产后引起了感染。
人流手术通常会对子宫内膜造成一定的创伤，创伤面可能会伤及局部的血管神经而出现疼痛。术后的宫缩会促使宫腔内的残留物完全排出，宫缩也会引起小腹部的坠痛。日常生活中，注意腹部的保暖，可遵医嘱服用一些活血化瘀的药物，促使宫腔内的残留物完全排出，同时可适当地使用消炎药，以预防感染，注意防止腹部受凉，尽量保持外阴的清洁干爽，人流手术术后小腹坠痛通常3到7天会慢慢缓解。
患者尽早尽可能的下床活动，这样可以加快肠蠕动，可以让更快的排气。第二种，如果患者出现腹胀的情况，但是活动能力有限，可以采取开塞露辅助的办法，这样可以给予肠道刺激，加快其排气排便。另外，最后一种如果以上办法效果都比较差，可以给与中药的保留灌肠或者是针灸的一些穴位刺激，从而加快肠道的蠕动，从而达到快速排便的排气的目的。
一般人流后出现肚子痛是子宫收缩引起的，不超过一周的时间。术后要保持会阴部卫生，加强营养，注意休息好，避免着凉，术后一个月内禁止性生活。以后同房时还是采取合适的避孕措施，经常人工流产会影响身体健康的。
