骨髓穿刺是一项很安全的检查方法，抽取一点骨髓液做检查，就像采血检查一样，没有后遗症。骨髓穿刺同时与静脉取血毕竟有所不同，广义上讲，骨穿也属于创伤性检查之一。加之目前国所用骨穿针均非一次性耗用品，故极少数情况下可能在操作过程中发生穿刺意外情况。
甲状腺疾病可根据需要选择穿刺的方法，进一步明确诊断。所有的医学处置都有创操作，有可能出现并发症和后遗症，穿刺常见为穿刺部位感染，患者有明显疼痛，进而发热，检查站有明显炎症反应，必要时需抗感染治疗。
穿刺术后局部可能疼痛，一般能耐受，逐渐减轻。恶性病变穿刺过程中，可引起肿瘤细胞移植性转移，但发生率非常低。穿刺过程中也容易引起邻近组织的副损伤，包括神经和血管损伤，患者也出现感觉异常。甲状腺供血非常丰富，严重时可能会导致血肿。
做腰椎穿刺并没有什么后遗症，大多数情况下做了腰穿以后需要卧床休息，一般需要注意不能枕头过高并不会产生什么后遗症，但是个别人在腰椎穿刺以后，可以引起颅内压降低或者是头痛的症状。
病毒性脑膜炎和脑炎是儿童时期比较常见的中枢神经系统感染性疾病，当病毒感染仅累及脑膜。当怀疑有脑炎或者脑膜炎时候，一般是建议做腰穿的。腰椎穿刺就是用针穿到脊髓腔抽取少量的脑积液，一般没有什么后遗症的，但是属于有创性检查的。
做羊膜穿刺检查不会有什么疼痛的感觉。具有适应症的孕妇先做B超，确定胎盘位置、胎儿状况，避免误伤胎盘。如无B超，触诊寻找囊性感大、易触及浮动胎体的部位，也可避开胎盘。
这个检查是没有什么后遗症的，在临床中仍在应用主要诊疗项目：阳痿、早泄、勃起功能障碍、性交障碍、性欲低下、遗精等常见男性性功能障碍，及由少精、死精、无精、射精障碍等原因引起的男性不育。
