男孩生殖器的发育可分为5个时期：
5-9岁时，睾丸比较小，直径小于2cm，第二性特征也不明显。8-11岁的时候，阴茎会变大，阴茎的根部和耻部会长出细小的、淡而柔软的阴毛，而阴囊的皮肤则是松软的淡红色。11-14岁的时候，阴茎会有很大的变化，首先是茎长茎粗，然后是阴囊，阴毛又多又硬又黑。14-16岁时，睾丸的直径达到4.1-4.5cm，睾丸达到了成年，阴茎变粗，阴囊变大，颜色变深，第一次遗精，持续3-4年，阴毛分布广泛，可扩展至腹股沟和耻骨上缘。17岁以后，睾丸、阴囊和阴茎的形态和尺寸都与成年人相近，且已趋于成熟，阴毛呈现男孩的棱形，而男孩生殖器增长速度则会在青春期加快。
儿童生殖器发育迟缓考虑是包皮过长，但有不少人到了成人时期包皮仍较长，只要经常注意卫生，把包皮翻起进行清洗，不让污垢堆积在里面，就既不会影响健康，也不会影响性功能。
儿童生殖器疼病因一般有两种。
1、泌尿系统感染时，因患儿有生理性包茎，感染不易被察觉，推荐做小便常规检查，然后进行抗感染治疗。
2、部分儿童可能会出现泌尿系统结石，引起生殖器疼痛。建议加重带着孩子到医院通过超声、ct等检查，然后合理治疗。
此外，家长应该注意让儿童保持良好的行为习惯，避免摩擦、抓挠生殖器。
大部分人从十二三岁开始进入青春期，青春期首先出现喉结和阴毛的生长，生殖器的发育大约是在15岁左右。发育期间一定要注意，不要经常用手去刺激，也不要看一些不健康的网站信息，以免引起性早熟。
儿童生殖器发育不良都是和遗传有关，但是也不排除一些男性疾病有关，比如睾丸炎、隐睾症、睾丸发育不全等都可能造成阴茎短小，但是对于小孩子来说看，孩子的生殖器还没有完全的发育完全，可以先观察看看，一般会慢慢好转，要是等孩子长大后还是短小，可以去医院做治疗。
