问题分析：怀孕的时间都是根据末次月经时间第1天进行计算的，根据您说停经45天，那说明怀孕45天左右了。
指导建议：并不是根据同房的时间来判断的，如果怀孕49天之内还能进行药物流产的，在流产前需要去医院进行全面检查一下，例如妇科方面的检查，B超方面的检查，还有抽血方面的检查，有适应症的情况下才能药物流产。
如果月经周期时间长有可能受精卵着床晚，目前还检查不到，可以一个星期后再次B超复查看看，不用担心的，与停经时间短有关系。必要时可以结合孕酮值与hcg判断，如果数值翻倍正常，就说明胚囊发育好，后期复查看看，不要过度担心，注意保持心情愉悦，多吃一些有营养的食物。
腿疼和腰疼的原因如下：
第一，间盘突出、间盘膨出等腰椎间盘退行性变化，都会导致腰腿疼痛，这是由于纤维环的破裂和压迫造成的。疼痛程度轻重不一，可能是轻微的，也可能是强烈的，还可能伴随腰椎活动受限。
第二，腰背纤维组织炎，主要表现为腰部、臀部、下肢等放散性疼痛以及腰椎活动受限等症状。
第三，腰肌劳损、急性腰扭伤等疾病也可能会引起相关症状。
一般情况下，来例假的时候会出现腿疼、腰疼、头疼等症状，通常是正常的。具体情况分析如下：
在来例假期间，女人会感觉到疲惫，情绪低落，可能是因为经期激素的含量发生了改变，女人在来例假期间要多休息，补充一些营养。此外，局部的症状是由于激素的水平改变导致血管扩张、盆腔充血。身体的一些地方的血管会因为膨胀而出现不适，会出现头疼、情绪低落、失眠、嗜睡等症状。局部有明显的痛楚，可以通过局部热敷、按摩等方式进行局部治疗。
停经40天b超未见孕囊考虑是排卵延迟，受精卵着床晚，还考虑是自然流产或者宫外孕的情况。正常月经规律的女性停经40天，如果确认已经怀孕，在宫腔内应该可见到大小在1.5-2cm之间的孕囊。
停经40天，怀孕天数在6周左右的，建议做好孕期保健工作。同时建议注意休息，少食生冷刺激性食物，考虑怀孕的前后3个月禁止性生活，防止导致流产的可能较好的，同时注意加强孕期营养，定期到医院检查胎儿的情况。
