一般情况下，指甲盖凹凸不平有小坑可能是真菌感染、营养不良等原因导致的。
1.真菌感染：创伤后可能会导致指甲被真菌感染，造成甲癣，此时可能会出现指甲异常生长的情况，导致指甲盖凹凸不平有小坑。
2.营养不良：如果缺乏营养，可能会导致甲营养不良，造成指甲生长比较慢，导致指甲盖凹凸不平有小坑，平时要适当补充营养，多休息。
如果我们指甲凹凸不平有小坑那可能是因为身体素质比较差，或者是缺乏维生素引起的，平时要调整好生活和饮食，作息规律，不要熬夜，饮食搭配合理，多吃新鲜蔬菜水果，吃清淡温和的食物，不要偏食，不要吃辛辣刺激性的食物，保持心情舒畅，适当参加户外活动，增强体质。
有四种可能，指甲营养不良，甲真菌病，外伤后或者某些皮肤病的甲改变。去医院就诊，先进行全身检查看是否伴有其他部位的皮肤损害，如若没有，进行甲屑真菌检查，排查灰指甲后，考虑甲营养不良可能性大，可以进一步完善微量元素检查，针对性补充微量元素。
平时饮食不均衡或者营养不良引起缺锌一系列的表现，平时均衡饮食，不要挑食，增加营养多吃鱼虾牛奶，海带等食品同时服用保健品比如葡萄糖酸锌，规律生活，注意休息，避免疲劳就可以了。
孩子指甲凹凸不平，常见的原因主要包括长期的缺乏营养，贫血或者是体内缺乏辛硫蛋白质等微量元素，可以做微量元素检测，可以明确。指甲凹凸不平，还有可能是灰指甲，因为真菌感染可以破坏甲床。
手指甲凸凹不平常因为维生素微量元素缺乏有关，建议要饮食清淡规律加强营养，不要挑食，补充维生素微量元素，注意手指清洁卫生，适当手指活动按摩活动促进循环，必要时可以考虑就诊检查明确病因。
