精子畸形率高的原因包括感染、个人的生活习惯、工作环境、染色体的异常等。
第一，精子畸形率较高，主要有支原体，衣原体，普通细菌等，还有疱疹病毒感染体，巨细胞病毒感染等。
第二，饮食不当、酗酒、抽烟等都会导致精子畸形。
第三，工作环境，长期从事焊接，长时间处于高温下，长时间暴露于化学物品中，都会导致精子异常。
第四，有些病人可能因为技术上的原因，或者是染色体的不正常，导致了高的精子畸形。
遗传基因缺陷，尤其是染色体异常的胚胎。外界不良因素，比如环境的原因，大气污染，还有一些化学物质和物理因素，可以直接或间接的对胚胎造成伤害。母体的因素，由某些全身性疾病可以引起胚胎死亡。内分泌功能失调，比如黄体功能不全，甲状腺功能低下等。
引起精子畸形的常见原因有内分泌功能下降;生殖系统与泌尿的某些感染;酗酒引起的精子畸形;吸烟会使畸形精子发生率明显增高。生活中可以把这些因素尽量避免！年轻男性如果是长期久坐如司机的职业也会出现精液影响。
正常成年男性的精液中，也存在着一些异常的精子，所占比例低于30%，多不会引起生理和生育功能。如果畸形精子率超过50%以上，则称为高畸形率和导致不孕不育症的发生。临床上多见于睾丸炎或附睾炎所引起的症状。患有精子畸形率高于50%的患者应去医院男科做详细的检查后进行治疗。
精子畸形是容易导致胎停育的，孕五十天会有胚芽和原始心管搏动，建议一周后进行复查的，如果还没有胎心搏动，那么胎停育的可能性比较大。需要注意休息，注意饮食，可以一周后进行超声检查的。
稽留流产是胚胎停止发育后没有及时排出体外，滞留在宫腔内称为稽留流产。导致稽留流产的原因很多，如胚胎染色体异常，怀孕后激素水平异常，子宫内膜异常，子宫黏膜下肌瘤，药物影响，或接触毒性物质和放射物质等均可导致胚胎停育。发现稽留流产要及时住院治疗，可用雌激素3-5天后行清宫术，也可以行药物流产，必要时清宫。
