宝宝半夜发烧39度应该及时遵医嘱使用口服布洛芬混悬液来治疗，要遵医嘱。
布洛芬混悬液的退热效果很好，一般在半小时之内会出现明显退热，但退热时间维持不稳定，大约4到6小时，但是该药用药间隔至少4到6小时，24小时运用最多不能超过四次，并且使用该退热药物的时候，一定及时给宝宝补水，避免造成脱水，另外要遵医嘱使用。
孩子发烧观察孩子面色。如果孩子面色如常或者潮红，可以安心在家中护理。若面色暗淡、发黄、发青、发紫，眼神发呆，则说明病情严重，应送医院。观察孩子有无剧烈、喷射性呕吐，如有说明有颅脑病变的可能，应去医院。观察孩子有无腹痛和脓血便，不让按揉的腹痛提示急腹症，脓血便提示痢疾等，也必须上医院。
孩子发烧尤其是高烧，应及时给孩子服用退烧药物。不及时退热治疗会造成对大脑的损伤。中药退烧药相对安全，除退热外，还能起到抗菌抗病毒的作用，改善咳痰、咳嗽、咽部症状疗效优于西药。
宝宝发烧了可以通过使用药物、物理降温、饮食调理等方法进行治疗。宝宝发烧了可以使用布洛芬、对乙酰氨基酚、小儿牛黄清心散或羚羊角颗粒或清开灵颗粒等药物退烧。也可以使用物理方式进行降温，如额头贴降温贴、温水擦浴、温水澡等。此外如果是母乳喂养，家长还需要注意饮食规律，多吃清淡、易消化的食物，少吃辛辣刺激的食物，以免通过乳汁对宝宝造成影响。
一般情况下，宝宝肛门38度算发烧。具体分析如下：
正常人在体温调节中枢的调控下，机体的产热和散热过程经常保持动态平衡，当机体在致热源作用下或体温中枢的功能障碍时，使产热过程增加，而散热不能相应地随之增加或散热减少，体温≥37.3℃称为发热。正常情况下，婴儿的肛门体温最高可达37.9℃，当动态温度超过38.0℃时，应考虑有发烧。需要及时就医，在医生的指导下进行检查，对症治疗。
一般情况下，宝宝发烧，肛门推针的方法并不好。
宝宝发烧时，大部分家长都会比较着急，希望宝宝快点好起来，但是不建议在宝宝肛门处推针治疗。宝宝发烧多是局部感染性疾病引起的，建议家长在医生的指导下按时、分次给宝宝口服药物。宝宝发烧，如果家长采用肛门推针的方式给宝宝治疗，可能会刺激宝宝肛门处，从而使宝宝感到不适。而且在肛门处用推针用药，经静脉回吸收的药物，无法估计药量，如果超过肝脏的负荷，可能会导致效果降低，还损害肠道功能。
