肾盂肾炎的感染途径包括上行感染、血行感染、淋巴道感染和直接感染。上行感染是病原微生物通过尿道进入膀胱输尿管、肾盂、肾盏导致的感染，是肾盂肾炎最常见的感染途径，致病菌是大肠埃希杆菌。
肾盂肾炎是由于细菌感染到肾盂部位而引起的。肾盂是肾脏产生的尿液所汇聚的部位，部位如果出现细菌感染，就称之为肾盂肾炎。肾盂肾炎的发生一方面和抵抗力降低有很大关系。
糖尿病通常会导致急性肾盂肾炎。
糖尿病患者免疫力低下，容易引起泌尿系统感染。糖尿病患者因治疗不及时或不当出现肾盂肾炎、肾乳头坏死、感染性休克等并发症时，治疗时间为两周。一般90%的患者治疗两周就能恢复，两周后尿细菌仍呈阳性。根据药敏试验，选择有效的抗生素继续治疗四至六周。感染严重、全身中毒症状明显者应住院，静脉注射抗生素。如果病情好转，可以在退烧后继续服药三天，然后改为口服抗生素，完成两周的疗程。如果治疗72小时仍无改善，应根据药敏试验更换抗生素，疗程不少于两周。
女性产后尿道和膀胱张力降低，膀胱对充盈不敏感，易造成尿潴留而引起细菌繁殖。分娩时，由于膀胱受压而引起黏膜充血、水肿，易致膀胱炎。而膀胱内含菌尿液可返流至肾引发肾盂肾炎，这也是肾盂肾炎的原因中一个不容忽视的现象。
引起慢性肾盂肾炎的原因：尿路梗阻所致，肾结石、尿路变窄、神经源性膀胱、肿瘤等，如果不及时解除梗阻，就会导致尿液流通不畅，回流到膀胱里，引起膀胱炎，尿液在体内潴留，有害物质就会侵害肾脏，再加上抗菌能力降低，身体里就会滋生大量细菌，从而引发肾盂肾炎出现。
本病致病菌绝大多数为革兰阴性杆菌，以大肠杆菌最常见。主要感染途径是上行性感染，即致病菌由尿道上行入膀胱引起膀胱炎，继而沿输尿管向上蔓延至肾脏，导致肾盂肾炎。肾盂肾炎治疗主要是进行积极抗感染治疗，如果用药物治疗7天没有效果需要复查血常规以及尿常规，如果没有明显好转，需要选择尿培养，选择敏感抗病毒药物进行治疗。
