衣原体感染的患者可以口服大环内酯类、红霉素类药物，也能起到一定的作用。
红霉素、罗红霉素、阿奇霉素等是红霉素类药物，大环内酯是治疗支原体衣原体的主要选择，阿奇霉素和克拉霉素半衰期短，消化不良，生物利用性好，在临床上有一定的应用价值，效果比较好。
肺炎衣原体感染后，一般会出现高热、白细胞增多、C反应蛋白升高等症状，但主要表现为咳嗽、咳痰或有少量粘痰。如果是胸闷、气急的患者，可以服用大环内酯药物，病情比较重，特别是肺脏比较大的患者，可以通过静脉注射大环内酯类药物，红霉素、阿奇霉素有是静脉制剂。另外，成人还可以服用左氧氟沙星、莫西沙星等喹诺酮类的药物，如果病情严重的，可以通过静脉给药。在进行抗菌药物的同时，还要配合使用解痉平喘、止咳化痰等药物，多喝水，多休息，不要吃辛辣的食品和其他的化学成分。
由于患者个人体质差异和病情情况，疣体用什么药最好需根据实际情况来判断。
因为常见的是寻常疣、扁平疣、跖疣、尖锐湿疣、疣状表皮生长不良等，可在医生指导下使用维A酸乳膏、氟尿嘧啶软膏、酞丁胺霜、咪喹莫特乳膏等。但效果因人而异，并无最佳效果的说法。
长有疣体的患者，可遵医嘱选用维A酸类，抗病毒类等药物治疗。
1、维A酸类：常用有维A酸乳膏等、他扎罗汀的乳膏，主要通过调控角质细胞的分化、抗增殖并起作用。
2、抗病毒类：含重组人干扰素α2b软膏等、盐酸左旋咪唑搽剂、鬼臼毒素酊等，主要通过对病毒复制的抑制作用来实现。
去除疣体可以在医生的指导下使用咪喹莫特软膏、水杨酸软膏、氟尿嘧啶软膏等药物来做改善。
1.咪喹莫特软膏：咪喹莫特软膏属于非核苷类异环胺类药，具有抗病毒的功效，有一定的腐蚀性。
2.水杨酸软膏：水杨酸软膏的主要成分是水杨酸，具有溶解角质的效果，同时还具有一定的腐蚀性，能够达到腐蚀疣体的作用，可以帮助疣体尽快脱落。
3.氟尿嘧啶软膏：氟尿嘧啶软膏可起到消炎和杀菌的作用，同时还具有抗病毒的效果，通常能够用于治疗各种疣体疾病，比如尖锐湿疣、扁平疣、寻常疣、丝状疣等。
肺炎衣原体感染引起的肺感染，与支原体卡他莫拉菌、嗜血杆菌、军团菌感染的处理方式一致。
红霉素、罗红霉素、克拉霉素、阿奇霉素等是临床上常用的大环内酯类药物，根据肺炎衣原体感染的轻重，可以通过口服和静脉给药。
肺炎衣原体感染一般不会出现严重的全身炎症反应，主要表现为高热、白细胞增多、C反应蛋白升高。
