巧克力囊肿要到正规的三甲医院进行诊断，根据不同的病情来制定合理的治疗方案，接受系统、科学的治疗，只有对症治疗才会提高治好的几率，千万不要盲目去治疗，以免加重病情。
左侧巧克力囊肿3cm可以用药物治疗。一般卵巢囊肿都是属于良性的病变。建议多注意观察，如果长期不能恢复，建议采取手术治疗。卵巢囊肿和个人的激素水平有很大的关系。建议根据个人的实际情况，听取医院主治医生的建议，做出进一步的判断。
巧克力囊肿还不算特别的大，暂时还不用手术，可以先用中药调理一段时间平时要避免劳累剧烈运动，避免油腻辛辣刺激饮食，过一段时间再复查一下B超，看看囊肿的变化，如果有增大明显，再考虑手术处理，剥除囊肿。
巧克力囊肿的分类有多种，可以分为功能性囊肿、卵巢囊肿、浆液性上皮囊肿及黏液性上皮囊肿、出血性囊肿，有时候出血性囊肿会合并腹腔内出血，还有子宫内膜样瘤、畸胎瘤、卵巢癌、子宫内膜异位瘤这些分类。
巧克力囊肿确诊良性还是恶性应该予以手术探查的，囊肿切除之后立刻在手术室里进行冷冻切片显微化验，以确定囊肿是属良性或恶性。这种囊肿可以逐渐增大，有时会在经期或经后发生破裂，但很少发生恶变。
切除子宫卵巢巧克力囊肿一般就不会复发了。巧克力囊肿又名卵巢子宫内膜异位囊肿，是子宫内膜异位症的一种。一般子宫内膜生长在子宫内，但是在月经期的时候由于子宫内膜的脱落。
