使用漱口水时，先用清水漱口，用力反复几次，尽可能多得清除口腔食物残渣，然后再含10毫升左右的漱口水，类似这样的方法在口腔反复几次，时间维持一分钟左右，然后就不需要用清水二次漱口了。
用漱口水后仍需刷牙，漱口不能代替刷牙，只能作为口腔护理的辅助用品，无法彻底清除牙面上的菌斑及细小缝隙中残留的食物，不能完全发挥预防龋病的作用。治疗型和保健型漱口水使用前最好向医生咨询，抗菌成分的漱口水不适宜长期使用，容易引起口腔菌群的失调，引发一系列的口腔黏膜疾病。每天早晚2次刷牙非常必要。
漱口水可以起到预防口腔疾病的作用，而且用于平时的清洁口腔卫生还是可以的。因为漱口种中含有一些化学制剂，可以帮助清洁牙齿，而且漱口水还可以改善口腔的异味等症状，不过即便使用漱口水，一定要按照正确的方式，每天坚持刷牙才可以。
患有牙周炎之后经常使用漱口水确实有一定的作用，但是平常应做好口腔的清洁，而且应该把口腔里面的食物残渣全部都给清理干净，必要时可使用牙线清除，这样可防止牙菌斑的出现。因为多数的患者在出现牙周炎之后，考虑是由于牙菌斑引起的，而且在治疗牙周炎时，应及时到医院牙科诊所去除牙齿上的牙结石，然后再解决牙周炎的问题。
一般情况下，龋齿痛可以用氯己定漱口水。但是用漱口水并不能治疗牙疼，漱口水只能辅助保持口腔卫生。龋齿痛的原因可能有很多，包括龋齿、牙髓炎、根尖周炎等。
建议患者及时到医院完善相关检查，明确病因后进行对症治疗，改善不适。同时建议患者在平时要保持口腔部位的清洁卫生，饭后漱口。平时也要少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，保持充足的睡眠，少熬夜。