口腔溃疡的治疗以消除病因、增强体质、对症治疗为主，治疗方法应坚持全身治疗和局部治疗相结合，中西医治疗相结合，生理和心理治疗相结合。口腔溃疡常呈周期性发作，复发时间长短与口腔溃疡病史长短有密切关系。
口腔溃疡的临床症状就是溃疡表面凹陷，呈圆形，表面有白色或者是黄色的假膜覆盖，溃疡周围有红色的充血带，病人常常有强烈的疼痛感，特别是进食辛辣食物时疼痛感加重。口腔溃疡一般都有自限性，一般在一周到两周内，溃疡可自限性愈合。
碘甘油为消毒防腐剂，其作用机制是使菌体蛋白质变性、死亡，对细菌、真菌、病毒均有杀灭作用，用于口腔黏膜溃疡、牙龈炎及冠周炎。碘甘油是外用的药物，不能内服的外用，用棉签蘸取少量本品涂于患处，一日2-4次就可以了，也可以用西瓜霜喷剂来治疗，效果也是很好的，西瓜霜喷剂是可以口服的。
维生素的缺乏，病人比较挑食，不喜欢吃水果蔬菜，很容易诱发复发性口腔溃疡。还有免疫系统问题，如果病人本身患有自身免疫系统类的疾病，也容易引起复发性口腔溃疡。或者病人的精神因素，如果经常处于精神紧张的状态，或者学习很辛苦，没有得到适当的休息，没有良好的睡眠，也容易引起口腔溃疡。
口腔溃疡癌变比较严重，可能会表现成口腔溃疡还有癌性溃疡。手术只能切除看得见的肿瘤，对于残存在血液和淋巴中的癌细胞无能为力，所以术后也要做好巩固治疗，以防复发和转移。
