直肠黏膜皱褶少，无绒毛，吸收面积小，药物吸收比较缓慢，进入血液循环的药量特别有限。另外，灌肠也不是一种安全、无菌的给药方式，肠道内含有很多细菌，有可能随着滴入液进入肠道深处，造成污染。
小孩感冒咳嗽，不建议使用灌肠，除非是直肠处使用的药物，例如：布洛芬或醋氨酚栓。
不推荐进行灌肠，主要是因为灌肠的药量控制不住，可能导致治疗的效果不佳，其次会导致肠粘膜受损，肠道菌群紊乱，甚至出现肠穿孔，肠出血，肠坏死等不良反应。一般的感冒和轻度的咳嗽都是可以自行治愈的，但是出现了呼吸道感染，最好是服用一些药物。
宝宝出现发热，为防止发生高热惊厥，要退热处理。如果不能配合口服退热药，可以通过温凉的生理盐水灌肠进行物理降温，效果较好。一天灌肠一次即可，防止多次灌肠引起肠黏膜损伤，继发引起腹泻。
灌肠除了对肠粘膜有一定的刺激以外，对孩子的身体健康无大碍。建议灌肠过程中注意保暖，避免受凉，选择粗细适宜的肛管，动作应轻柔。灌肠过程中及灌肠后应注意观察病情，如发现面色苍白，异常哭闹，腹胀或排出液为血性时，应立即停止灌肠。
小孩发烧的时候进行灌肠治疗，主要的作用是进行退烧，不仅退烧的速度快，而且退热的持续时间也比较长，对于孩子的胃肠黏膜损伤也比较小。灌肠的时候，如果操作比较粗鲁，容易造成孩子直肠黏膜或者是肛门损伤，还有可能会感染。操作的时候要轻柔。
一般情况下，半岁宝宝发烧使用灌肠方法是比较好的。
灌肠一般是使用生理盐水、抗生素、抗病毒药、激素或中药及中药注射液等，通过直肠给药达到降温的目的，灌肠主要是通过直肠吸收药物，对全身的副作用很小，而且直肠黏膜血液旺盛，吸收能力强，药物能快速吸收。并解决了小孩吃药难，打针痛的问题。建议一天灌肠一次即可，防止多次灌肠引起肠黏膜损伤，继发引起腹泻。
