卵巢囊肿手术治疗的方法，由自身综合情况来选择的。如果，年龄比较大，没有生育要求了，可以选择同时切除卵巢，这是指卵巢上是良性的肿瘤，如果卵巢上的肿瘤是恶性的，那就是必须要切除卵巢了。
卵巢旁边有个小囊肿可以通过手术治疗、使用药物等方法进行治疗。
卵巢旁边有个小囊肿一般指卵巢囊肿，而卵巢囊肿是卵巢内或其表面形成的囊状结构，一般不会对人体造成损害，大多数患者的可自行消失，但部分患者的囊肿可不断增大，引起下腹部不适、月经异常等，可以通过手术进行治疗，比如卵巢囊肿剔除术、单孔腹腔镜下卵巢囊肿剥除术、卵巢切除术等；也可以使用药物进行治疗，比如头孢拉丁胶囊、左氧氟沙星片等。
乳腺囊肿没有药物，进行针对性治疗的，可以对症用手术切除的方法或微创的方法进行治疗。应保证心情舒畅，多吃蔬菜水果类的食物，避免进食油腻辛辣的食物，建议宜合理饮食，注意休息。
怀孕后胎膜囊肿不会消除，只要它不影响孩子，它不影响血液循环，也不影响胎儿血液循环。没必要处理。囊肿对胎儿有很大影响。可以进行内窥镜穿刺和引流。减轻子宫压力以达到治疗目的。手术中有许多并发症，如胎膜早破。
咽喉部有囊肿需要尽快进行手术治疗。咽喉部囊肿最常见的就是会厌囊肿以及声带囊肿，会厌囊肿常发生在会厌舌面以及会厌谷处。在治疗上可以行支撑喉镜下会厌囊肿摘除术，手术需要住院。术后还需要进行禁声治疗，低声少语，避免局部复发。
体积较小不严重，体积大是严重的。脑囊肿的严重程度主要和大小和生长位置有关。体积较小没有不适这类脑囊肿是不严重的，脑囊肿体积比较大，有头痛、恶心、肢体功能障碍，严重者会出现癫痫，相对比较严重，需要手术治疗。
