三个月的宝宝大便次数在1到3次或两三天一次都属于正常情况。母乳喂养的宝宝，大便次数要相对吃奶粉的宝宝次数要多一些。如果平时宝宝的大便次数较多，但是发育情况良好，体重没有减轻，也属于正常情况。如果排便次数增多，有稀便，或有白色的奶瓣，蛋花样的，便考虑有消化不良。如果大便次数减少，出现大便干燥，说明有便秘的现象。可以用妈咪爱等来调整肠道的菌群。
如果肛裂一直不好，反复发作，肛裂的创面就会慢慢纤维化，这种肛裂往往难以自己恢复，需要手术治疗。在手术之前一定要改善排便习惯，否则手术效果难以得到保证。适当增加膳食纤维的摄入，多喝温开水，多吃新鲜水果蔬菜，避免大便干结，避免排便困难，避免排便费力。
三个月的宝宝出现消化不良的情况，可以通过以下方法缓解：
1、按摩腹部。可以顺时针按揉上腹部，使其具有一定的穿透性，有利于肠道的蠕动影响。可以通过滴眼液。
2、服用药物。可以通过口服干草二联杆菌等的益生菌来调理肠道菌群，帮助消化吸收食物。
3、更换奶粉。婴幼儿使用的奶粉中含有大量的油脂，很有可能会导致消化不良，可以通过更换配方来缓。
对于三个月的宝宝每天至少大便一次，长时间都不大便可能会导致毒素的吸收，会对宝宝的正常生长发育产生影响。宝宝的年龄比较小胃肠功能是比较薄弱的，吃奶过多或者奶的质量发生了改变，都有可能出现胃肠功能的紊乱，会出现大便不规律。
三个月的宝宝，如果是纯母乳喂养，大便次数一天在五次以内，考虑是正常的，如果大便次数超过五次，而且有稀水样或蛋花样大便，要考虑孩子存在腹泻的情况，这个就要去医院检查大便常规。如果是人工喂养的宝宝，一般大便次数在每天三次以内属于正常，如果次数超过三次，要考虑是否有消化不良或者腹泻的表现才可以。
有可能是病毒感染，常见的就是轮状病毒肠炎引起，如果是母乳喂养，可以继续母乳喂养，尽量要少吃。人工喂养吃奶粉，暂时停奶粉喂养，买一些低脂的奶粉或者是腹泻奶粉。