小儿在腹泻时多少都伴有肠道菌群的紊乱，可服用一些肠道微生态制剂，或肠黏膜保护剂。肠道微生态制剂和肠黏膜保护剂可以帮助缩短腹泻病程，效果良好。婴儿腹泻治疗方法具体还要看孩子的病情。病症重则需要去医院就医。
宝宝吃母乳拉肚子时，应该及时就医，在医生的指导下，进行对症治疗。以母乳为主要诱因的小儿的腹泻，临床上叫做母乳性腹泻，一般多发生在六个月以内，纯母乳喂养的宝宝身体上。一般母乳性腹泻的宝宝无需治疗，就是继续哺乳就可以了，随着宝宝成长，添加辅食自然就会好转。但是如果宝宝有发热呕吐、小便减少、或者体重增长不佳，就要及时就医了。
婴儿腹泻推拿的方法是按揉宝宝的足三里，以膝盖髌骨下方的凸起处为起点，向下四指宽胫骨外侧，用大拇指的指肚按揉这一点100-200下。也可以把手掌摊开，放在宝宝的腹部，逆时针轻揉50下左右，但一定要逆时针揉腹，顺时针揉腹则是调理便秘的。还可以让宝宝平躺在床上，用一手的食指、中指、无名指并拢，用三指指腹在宝宝腹部绕圈按摩。以腕关节连同前臂作顺时针或逆时针方向环形移动摩擦，每次3-5分钟。
婴儿腹泻可以母乳喂养。
婴儿的胃肠道比较脆弱，进食过多可能会导致婴儿腹泻，但是一般不会影响母乳喂养，因为母乳中含有乳清蛋白、酪蛋白、乳铁蛋白、溶菌酶等营养物质，并且比例相对合适，适合婴儿的胃肠道，不会增加胃肠道的消化负担，一般不会造成不良影响。但是需要注意的是，婴儿腹泻时需要适当减少母乳喂养的次数和量。
吃母乳婴儿腹泻大便，如果宝宝没有哭闹等不适，精神状态好，胃口好，身高和体重增长都很正常，这是正常的，不需要特别的处理，等过了一个月，这种情况就会逐渐消失。
如果宝宝食欲不佳，出现脱水症状，可以通过口服肠道益生菌来调节肠道菌群的平衡。比如双歧三联活菌散、乳酸菌素片等。在孩子拉肚子的时候，妈妈要避免吃生冷辛辣的食物。如果孩子的腹泻症状减轻了，可以适当的调节一下自己的饮食。
腹泻是由于胃肠功能紊乱，着凉，乳糖不耐受，如果是母乳的话，母亲不注意饮食造成的，容易造成孩子消瘦，营养不良，建议可以带他去医院进行检查，通过药物进行治疗，平时应该注意饮食，让孩子使用益生菌进行调理。
