霉菌性尿道炎如果偶然发生，尿培养确诊为霉菌感染，就口服药物一周。如果是反复复发的霉菌性尿道炎，女性一般与身体抵抗力弱、口服抗生素、与其性交的男士包皮过长有关，必须去除这些病因，多吃新鲜水果蔬菜、多吃牛羊肉、海参，增强体质。发生疾病时不要滥用抗生素，建议男士割掉包皮。
霉菌性尿道炎可以通过药物治疗、生活护理等方式进行改善。
霉菌性尿道炎是一种比较少见的疾病，主要是由于长期服用抗生素，或是在抗生素中不合理的使用而引起的。这是一种孩子的传染病。如果是霉菌性尿道炎，需要做尿检，尿液中有孢子，也有尿培养。如果尿道炎的症状不严重，可以停止使用抗生素，同时使用抗霉菌的药物，目前临床上使用的主要是大扶康，一般在治疗三天之后，要及时复查尿常规，检查尿常规有无霉菌孢子。
克林霉素治霉菌性尿道炎。
克林霉素的抗菌谱主要是用于治疗表皮、关节、腹腔、妇科感染等，其抗菌谱主要用于治疗皮肤、关节、腹腔、妇科感染等，但在尿液中的含量较少，不宜用于泌尿系统感染。如果病人对克林霉素过敏，在尿培养和药敏实验中，可以选用克林霉素。
尿道炎通常是细菌性的，但从表现来看，是由不洁性生活引起的霉菌性尿道炎。这种疾病主要是抗霉菌的，但是口服药物的许多副作用都很大。主要是外生殖器的外用，用于换衣、消毒使用的衣服和床上用品、清洁马桶和其他接触到的物品，以及预防家庭成员感染直至康复。
感染了霉菌性尿道炎应该要保持外阴的清洁卫生，保持干燥，不要搔抓，不宜食用辛辣刺激性食品。治疗期间禁止性生活，平时要讲究卫生，勤换内衣尤其是裤头.换下的衣物一定要煮熟消毒处理。
男性霉菌感染多见于念珠菌感染，多是因性同伴有霉菌感染，通过性接触后导致。霉菌在弱酸性环境繁殖较快，感染后常出现尿道刺痒、轻重不一的尿频、尿急、尿痛和排尿艰苦。尿道口有粘液性或脓性分泌物，量较少。到医院检查一下，明确致病菌后再进行治疗。平时注意个人卫生。